科研产出
基于简化基因组测序的吐鲁番黑羊遗传结构分析
《中国畜牧兽医 》 2025 北大核心
摘要：【目的】研究吐鲁番黑羊育种核心群种公羊的群体遗传结构及亲缘关系，探讨吐鲁番黑羊的遗传多样性，评估其群体遗传结构，为制定合理的选种选配方案及吐鲁番黑羊品种保护策略提供数据支持。【方法】利用简化基因组测序技术对128只吐鲁番黑羊公羊单核苷酸多态性(SNP)位点进行检测，通过PLINK 1.90、R 4.4.1软件对吐鲁番黑羊群体遗传多样性及连续纯合片段(ROH)进行计算，利用Mega 10.0软件构建系统进化树，综合评估吐鲁番黑羊的群体遗传结构。【结果】吐鲁番黑羊公羊群体平均观测杂合度为0.16,期望杂合度为0.18,次要等位基因频率为0.23,多态信息含量为0.82。通过主成分分析与系统进化树发现，128只吐鲁番黑羊被分为5个亚群。遗传距离(D值)为0.1626～0.2749,平均遗传距离为0.2635,IBS遗传距离与亲缘关系G矩阵一致，显示吐鲁番黑羊群体内大部分个体间亲缘关系较远。128个吐鲁番黑羊公羊个体共检测到2 239个ROHs,其中，0～5 Mb数量最多，占比为61.37%;基于ROH的平均近交系数为0.04,表明近亲繁殖水平较低。【结论】吐鲁番黑羊育种核心群遗传多样性丰富，大部分个体间亲缘关系较远，群体内近交程度较低，具有较好的遗传资源保护和开发利用的基础。本研究结果可为吐鲁番黑羊核心群制定育种计划及开发利用提供参考依据。
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34份玉米种质材料的亲缘关系分析
《草原与草坪 》 2018 CSCD
摘要：使用56K的基因芯片对34份玉米种质资源进行基因组水平上的分子鉴定。34份玉米种质材料在遗传结构上可以分为籽粒玉米种质和青贮玉米种质两种类型,大部分未知种质的遗传结构中青贮种质的遗传比例相对较大。通过亲缘关系分析发现种质材料亲缘关系较远的前5个种质材料分别为27(-5.000 64)>2(-3.300 79)>25(-1.475 92)>18(-1.352 37)>15(-1.217 94)。有20对种质材料间存在较大的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.2以上,25对种质材料间存在一定的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.1~0.2。大部分未知青贮种质在遗传结构上具有较大的青贮种质遗传比例,是潜在的青贮玉米种质创新材料;种质材料27、2、25、18、15的亲缘关系较远。
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