采用SNP芯片分析博格达绒山羊群体遗传结构和遗传多样性

吕雪峰; 邢巍婷; 郑文新; 叶尔兰·谢尔毛拉; 赛迪古丽·赛买提; 王乐; 《黑龙江畜牧兽医 》 2025 北大核心

摘要：为了解博格达绒山羊群体结构和遗传多样性,试验采用山羊Illumina 65K SNP芯片对96只博格达绒山羊群体遗传多样性、近交程度、遗传距离和家系结构进行分析.结果表明:博格达绒山羊单核苷酸多态性(SNP)数量质量控制后为51 480个,有效群体含量(Ne)为11.8,多态性标记比例(PN)为0.902,群体平均期望杂合度为(He)0.379,观察杂合度(Ho)为0.364,平均多态信息含量(PIC)为0.284;共检测到1 545个连续性纯合片段(ROH)片段,平均长度为127.83 Mb,91只绒山羊的ROH片段长度在0~500 Mb之间;通过ROH计算的群体平均近交系数为0.052,状态同源(IBS)平均遗传距离为0.307 7;群体可以划分为14个家系.说明博格达绒山羊群体处于中度多态水平,遗传多样性较高,存在一定程度的近交,家系数量较多,但大部分家系公羊数量少,需要制订科学的选配计划,引入新的公羊品种或血统,以增加种群的遗传多样性.

关键词： 博格达绒山羊 SNP芯片 ROH 遗传多样性 遗传结构