基于SLAF-seq简化基因组技术的疆岳驴遗传进化分析

肖海霞; 阿布来提·苏来曼; 托乎提·阿及德; 努尔尼萨·莫拉尼亚孜; 张国庭; 帕热哈提江·吾甫尔; 王琼; 苏玲玲; 谢立荣; 刘应进; 买买提·克玉木; 田可川; 刘武军; 《安徽农学通报 》 2023

摘要：畜禽资源是中国种业创新、打赢种业翻身仗的根基.疆岳驴是陕西关中驴(大型驴)和新疆驴(小型驴)经过半个多世纪杂交改良、横交固定、选育提高、培育而成的良种驴,旨在基因组水平上揭示疆岳驴的遗传进化,解析疆岳驴的遗传结构及遗传多样性.该研究利用SLAF-seq简化基因组测序鉴定疆岳驴SNP标记,构建125头样品群体进化树并进行分析.共鉴定SNP标记4887196个;通过MEGA 5软件neighbor-joining算法,构建的群体进化树显示,125头疆岳驴聚集为2个大的分支:一个分支46头聚集在一起,亲缘关系较近;另一分支79头聚集在一起,亲缘关系较近.这2个分支间亲缘关系较远.通过admixture软件、EIGENSOFT软件、SPAGe?Di软件进一步佐证了125头疆岳驴可分为2个群体,利用SLAF-seq简化基因组测序能全面准确地揭示疆岳驴的遗传多样性和遗传结构,为疆岳驴的关联遗传学研究和重要性状QTL定位提供依据,为争取在第3次全国畜禽遗传资源普查申报新培育品种(配套系)和疆岳驴重要性状QTL定位奠定基础.

关键词： 疆岳驴 简化基因组技术 遗传进化分析