绵羊TMEM182基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析

刘璇; 李婧平; 马海叶; 张倩雯; 王嘉俊; 李忠慧; 李文蓉; 《草食家畜 》 2024

摘要：【目的】本试验旨在克隆绵羊TMEM182基因编码区（CDS）全长序列，并通过在线软件分析TMEM182基因结构和表达蛋白序列，以探究其在绵羊各部位组织中表达水平的变化。【方法】从绵羊尾部脂肪组织中克隆获得TMEM182基因，利用在线生物学信息软件对TMEM182蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区、糖基化位点、信号肽、二级结构、三级结构和蛋白互作等进行预测分析。同时，采用实时荧光定量PCR方法检测TMEM182基因在绵羊13个组织中的相对表达量，这些组织包括大脑、小脑、心、肾、脾、肝、肺、皮肤、卵巢、尾部脂肪、皮下脂肪、肾周脂肪和肌肉。【结果】绵羊TMEM182基因CDS区全长序列为690 bp，编码229个氨基酸，TMEM182基因序列在不同物种间具有较高的保守性。生物信息学预测分析显示，TMEM182属于稳定的疏水性蛋白，具有跨膜结构，无信号肽，具有3个N-糖基化位点，其蛋白二级结构主要由无规则卷曲（38.43%）和2α螺旋（30.57%）组成，而延伸链（24.89%）和β转角（6.11%）的占比相对较少，三级结构预测结果与二级结构预测结果相符。实时荧光定量PCR结果显示，TMEM182基因在肌肉、心和脂肪中表达量显著高于肝、肾、大脑、小脑、皮肤等其它部位组织（P<0.05）。【结论】成功克隆了绵羊TMEM182基因的CDS区片段，分析了该基因在绵羊肌肉组织和脂肪组织中特异性表达。这些研究结果为进一步探究TMEM182基因在绵羊肌肉生长发育和脂肪沉积过程中的分子作用机制提供了理论依据。

关键词： TMEM182基因 基因克隆 组织表达分析 生物信息学分析