科研产出
全基因组选择信号筛选和田羊异质被毛相关候选基因
《新疆农业科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】被毛类型是绵羊重要的品种特征之一，但是其形成的分子基础目前仍不清楚。筛选出与和田羊异质被毛有关的基因和通路，为进一步解析和田羊异质被毛的分子调控机制提供理论依据。【方法】对异质被毛和田羊和同质被毛中国美利奴羊的基因组信息进行选择信号分析，研究筛选出与和田羊被毛类型相关的候选基因。选取健康和田羊和中国美利奴羊成年母羊各15只，颈静脉采血，提取基因组DNA进行基因组重测序，基于全基因SNPs进行选择信号检测分析。将Fst和θπRatio的top1%作为阈值，筛选出SNPs位点进行注释，并对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，确定与和田羊异质被毛性状相关的候选基因和生物学通路。【结果】Fst和θπRatio两种方法共鉴别出732个受选择基因，这些基因被显著富集到多个与羊毛性状有关的KEGG通路和1条与毛囊发育有关的生物学过程通路。【结论】筛选出多个羊毛性状有关的通路和5个(BMPR2、LPAR6、RARA、CDC6和BNC1)可能与和田羊异质被毛相关的关键候选基因。
全文链接
请求原文
IRF2BP2基因与绵羊被毛类型和纤维直径的相关性研究
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究IRF2BP2基因的asEIF2S2插入和Chr25:t7068586c 2个突变位点对羊毛性状的影响，本研究以5个不同品种绵羊和特克赛尔×哈萨克羊杂交群体为研究对象，利用PCR、sanger测序技术等对2个位点进行基因分型，通过重量法、OFDA2000等测定被毛纤维含量和纤维直径，并分析了不同基因型与羊毛性状的相关性。asEIF2S2位点在单层被毛绵羊品种中为大片段插入纯合型(IRF2BP2asEIF2S2/asEIF2S2)，在双层被毛绵羊品种中为插入缺失纯合型(IRF2BP2wt/wt);Chr25:t7068586c位点在哈萨克羊、和田羊2个双层被毛群体中存在CC、CT、TT 3种基因型，且均符合哈代-温伯格平衡。中国美利奴羊羊毛纤维直径有较大变异范围（15.47～24.49μm）,Chr25:t7068586c位点在单层被毛绵羊品种中国美利奴羊中仅有突变纯合型CC；在特哈杂交群体中，2个位点突变纯合子绒毛含量均最高，被毛平均纤维直径也极显著低于其他2种基因型；哈萨克羊中，CC突变纯合子绒毛含量最高，但纤维直径在不同基因型间差异不显著。asEIF2S2插入突变纯合型和单碱基突变纯合型与绵羊单层被毛类型相关，asEIF2S2缺失纯合型与双层被毛类型相关，2个位点突变等位基因均有增加被毛绒毛含量的趋势，但与细羊毛纤维直径无相关。本研究首次系统分析了IRF2BP2基因与绵羊不同类型纤维含量和纤维直径间的关系，为解析IRF2BP2基因影响羊毛性状的机理及今后在育种中的应用提供了借鉴。
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
