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资源类型: 中文期刊
关键词:转录组分析(模糊匹配)
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中国美利奴羊毛密度相关基因的筛选

新疆农业科学 2025 北大核心 CSCD

摘要:[目的]分析中国美利奴羊毛密度表型差异,筛选影响中国美利奴羊毛密度性状相关的候选基因,为阐明中国美利奴羊毛密度的分子调控机制提供参考.[方法]采用毛丛法对中国美利奴羊的羊毛密度和毛囊密度进行测定、统计分析,选择不同羊毛密度中国美利奴羊皮肤进行转录组测序,鉴定与羊毛密度性状相关的候选基因.[结果]中国美利奴高羊毛密度组(HWD组)的平均羊毛密度(9 852.02±1 673.98)根/cm2,极显著高于低羊毛密度组(LWD组)(5 390.61±1 365.67)根/cm2(P<0.01).HWD组与LWD组平均初级毛囊密度差异不显著,HWD组的平均次级毛囊密度、初级毛囊密度与次级毛囊密度比值、平均总毛囊密度均极显著高于LWD组(P<0.01).利用羊毛密度显著差异的中国美利奴羊皮肤转录组数据,HWD组相对于LWD组,共筛选出521 个差异表达基因,其中280 个基因表达上调、241 个基因表达下调.通过高、低密度组间差异基因富集、差异基因互作和差异基因表达验证等分析,筛选出KRT18、KRT16、LOC101116157、CCN3、SPARC、C7、ATP12A、ANGPT4、WNT16、S100A1 及S100A4 等,影响了中国美利奴羊毛生长及密度的差异表达基因.[结论]不同羊毛密度的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差异,这些基因表达可通过改变皮肤毛囊及羊毛生长等过程影响羊毛密度.

关键词: 中国美利奴羊 羊毛密度 RNA-seq 候选基因

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无芒雀麦幼苗对温度变化的适应性策略

草地学报 2024 北大核心 CSCD

摘要:全球气温变化对植物形态、生理及分子调控产生不同程度的影响,改变了植物的生长状态。本研究为探究野生无芒雀麦(Bromus inermis)应对温度变化采取的适应对策,设置5个温度处理,分别为对照T1(15/5℃)、增温T2(17.5/7.5℃)、增温T3(20/10℃)、增温T4(22.5/12.5℃)和增温T5(25/15℃),观测其幼苗的表型和解剖结构,测定生理特征,利用转录组测序技术进行分析。结果表明:增温显著提高叶长和叶生物量分配,降低了叶片厚度和表皮细胞厚度,部分增温处理(T3,T5)减少根生物量分配并减小根系直径(P<0.05);增温使叶片中的可溶性蛋白含量显著降低(P<0.05),过氧化氢酶和过氧化物酶活性更强,形态和生理指标间相关性较弱;T5增温下叶片差异表达基因199个,根系484个。总体而言,无芒雀麦幼苗地上部分比地下部分对增温的响应更敏感。

关键词: 表型形态 解剖结构 生理特征 转录组分析

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转录组测序技术的研究和应用进展

生物技术通报 2019

摘要:转录组(Transcriptome)是指特定细胞或组织中全部转录产物,包括信使RNA,核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA.高通量测序技术的快速发展,为从整体水平系统地研究转录组学研究提供快捷可靠的平台.综述了当前主流的高通量测序技术及其在转录组学研究中的应用,并讨论了转录组数据分析中一些值得关注的问题,以及转录组测序技术在生物学研究中的应用方向.

关键词: 转录组 RNA-seq 二代测序 三代测序 单细胞转录组

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