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资源类型: 中文期刊
关键词:进化树(模糊匹配)
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新疆羊狂犬病病毒的鉴定及N基因序列分析

中国人兽共患病学报 2014 北大核心 CSCD

摘要:目的诊断疑似羊狂犬病病例并分析其病原分子N基因遗传进化关系。方法采集新疆阿勒泰地区疑似狂犬病羊脑组织,以狂犬病病毒特异性目的基因(N基因)RT-PCR扩增和序列测定进行病毒鉴定;以DNAStar-Lasergene.v7.1软件拼接测定序列,应用BLAST软件分析N基因的遗传进化关系。结果显示本研究鉴定的狂犬病毒阳性并获得了病毒全基因序列,建立了其N基因的遗传进化关系树,确定疑似的羊狂犬病病毒与狂犬病病毒基因Ⅰ型俄罗斯C群的遗传关系较近。结论应用RT-PCR方法对羊源狂犬病进行实验室诊断,获得该病原全基因序列,明确了新疆狂犬病病原和流行地域分布,为羊狂犬病毒分子流行病学研究奠定基础。

关键词: 狂犬病病毒 N基因 进化树

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新疆奶牛乳源大肠杆菌Irp2毒力岛的克隆及序列分析

新疆农业大学学报 2010 北大核心

摘要:采集新疆奶牛隐性乳腺炎乳样,经分离、鉴定,从中得到乳源大肠杆菌,并将大肠杆菌菌株用大肠杆菌O因子血清标定。根据GenBank已发表的Irp2基因序列,用Oligo 6.0生物软件设计一对特异性引物。对分离得到的大肠杆菌菌株提取基因组DNA,利用聚合酶链式反应(PCR)进行扩增。结果表明,所分离大肠杆菌中Irp2基因阳性率为35.3%(12/34),阳性样品的测序结果与已发表的Irp2基因序列高度同源,同源率在98%以上。同时发现Irp2基因的阳性率与血清型并没有相关性。

关键词: Irp2基因 甜菜碱 牛乳腺炎 序列分析 进化树

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