科研产出
采用SNP芯片分析博格达绒山羊群体遗传结构和遗传多样性
《黑龙江畜牧兽医 》 2025 北大核心
摘要：为了解博格达绒山羊群体结构和遗传多样性,试验采用山羊Illumina 65K SNP芯片对96只博格达绒山羊群体遗传多样性、近交程度、遗传距离和家系结构进行分析.结果表明:博格达绒山羊单核苷酸多态性(SNP)数量质量控制后为51 480个,有效群体含量(Ne)为11.8,多态性标记比例(PN)为0.902,群体平均期望杂合度为(He)0.379,观察杂合度(Ho)为0.364,平均多态信息含量(PIC)为0.284;共检测到1 545个连续性纯合片段(ROH)片段,平均长度为127.83 Mb,91只绒山羊的ROH片段长度在0~500 Mb之间;通过ROH计算的群体平均近交系数为0.052,状态同源(IBS)平均遗传距离为0.307 7;群体可以划分为14个家系.说明博格达绒山羊群体处于中度多态水平,遗传多样性较高,存在一定程度的近交,家系数量较多,但大部分家系公羊数量少,需要制订科学的选配计划,引入新的公羊品种或血统,以增加种群的遗传多样性.
关键词： 博格达绒山羊 SNP芯片 ROH 遗传多样性 遗传结构
全文链接
请求原文
34份玉米种质材料的亲缘关系分析
《草原与草坪 》 2018 CSCD
摘要：使用56K的基因芯片对34份玉米种质资源进行基因组水平上的分子鉴定。34份玉米种质材料在遗传结构上可以分为籽粒玉米种质和青贮玉米种质两种类型,大部分未知种质的遗传结构中青贮种质的遗传比例相对较大。通过亲缘关系分析发现种质材料亲缘关系较远的前5个种质材料分别为27(-5.000 64)>2(-3.300 79)>25(-1.475 92)>18(-1.352 37)>15(-1.217 94)。有20对种质材料间存在较大的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.2以上,25对种质材料间存在一定的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.1~0.2。大部分未知青贮种质在遗传结构上具有较大的青贮种质遗传比例,是潜在的青贮玉米种质创新材料;种质材料27、2、25、18、15的亲缘关系较远。
全文链接
请求原文
新疆褐牛种群遗传多样性分析
《新疆农业科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：【目的】检测新疆褐牛的遗传多样性及其不同居群(杂交类型)的亲缘关系。【方法】采用8对微卫星分子标记对新疆褐牛的4个群体进行遗传多样性与遗传结构分析。【结果】在192个个体扩增得到72个等位基因,每个位点平均等位基因数(A)为9。4个新疆褐牛群体的平均预期杂合度(HE)为0.716 2,平均观察杂合度(HO)为0.695 4,群体处于遗传平衡状态。群体平均多态信息含量和平均杂合度较高,4个群体8个位点的平均多态信息含量分别为0.673 6、0.622 0、0.626 5和0.541 3。群体基因流BM2133位点最大(7.096 5),BM1824位点最小(2.112 8),各位点平均基因流为4.008 9,4个群体间存在一定的基因交流。4个群体间的遗传变异为5.87%,另外94.13%的遗传变异由个体间的差异产生。基因流不是主导新疆褐牛种群遗传结构的关键因素。聚类分析显示4个群体可按遗传距离分为两类。【结论】新疆褐牛4个群体的遗传多样性丰富,可作为育种材料培育牛的新品种与新疆褐牛新类型。
关键词： 新疆褐牛 群体遗传变异 微卫星位点 多态信息含量 杂合度 等位基因数 遗传结构
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
