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资源类型: 中文期刊
关键词:HA基因(模糊匹配)
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H5N1亚型禽流感病毒新疆株HA基因的克隆及序列分析

中国兽医杂志 2008 北大核心

摘要:参照已发表的H5N1亚型禽流感的HA基因序列,设计了1对引物,对禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/3(H5N1)、A/Duck/XJ/4(H5N1)、A/CH/XJ/5(H5N1)、A/Goose/XJ/10(H5N1)和A/Duck/XJ/11(H5N1)进行RT-PCR扩增和克隆,获得了5个毒株的HA全长核苷酸序列,分别为1 779 bp1、774 bp、1 776 bp、1 758 bp和1 740 bp序列分析表明,在HA切割位点处均有多个连续的碱性氨基酸(-R-E-R-R-R-K-K-R-)插入,具有高致病性禽流感病毒的特征.同源性分析表明,新疆分离株之间的核苷酸同源性在96.9%~98.8%;与来自青海湖斑头雁、广西天鹅、香港白鹭和台湾鸽等不同野禽毒株同源性为95.7%~100%;与来自香港、越南、浙江的人源禽流感毒株的同源性为95.2%~98.2%。

关键词: 禽流感病毒 H5N1亚型 HA基因 序列分析

鹅源H5N1亚型禽流感病毒新疆株HA基因的克隆和序列分析

全国人畜共患病学术研讨会论文集 2006 CSCD

摘要:根据已发表的H5N1亚型禽流感病毒的血凝素(HA)基因序列,设计并合成了1对引物,利用RT-PCR方法扩增出鹅源H5N1亚型禽流感病毒新疆株A/Goose/XJYL/10/2003(H5N1)HA基因,然后将其克隆到pMD18-T载体上,获得了全长为1758bp的HA全基因序列,其氨基酸切割位点附近具有碱性氨基酸插入,具备了高致病性禽流感病毒的特征。利用DNA分析软件,与GenBank中已发表的同一亚型禽流感病毒HA基因的参考进行比较分析表明,本试验株与香港、广东、广西、浙江等南方地区2000-2004年间的H5N1禽流感毒株HA基因核甘酸序列同源性在98.0%-98.7%之间,的H5N1禽流...

关键词: 禽流感病毒 H5N1 HA基因 克隆 序列分析

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