H5N1亚型禽流感病毒新疆株NS基因的克隆和序列分析

雷程红; 成进; 崔尚金; 李曦; 沙依兰古丽; 符子华; 巴格得力; 盛卓君; 孙浩; 《中国兽医科技 》 2005 北大核心 CSCD

摘要：根据已发表的H5N1禽流感病毒NS基因全序列设计了1对引物,对4株禽流感病毒新疆株的NS基因进行了RT-PCR扩增,并将其克隆到pMD 18-T载体上,分别获得了全长为817、851、8548、54 bp的全基因序列。序列分析结果表明,新疆毒株间的核苷酸同源性为97.8%~98.9%,氨基酸同源性为96.5%~98.7%,与广东、香港和东南亚等不同地区的11个毒株比较,同源性为90.0%~99.4%;与来自野禽、猪等不同种类的11个流感毒株比较,同源性为81.4%~99.3%。系统进化树分析表明,新疆株独立分支。

关键词： 禽流感病毒 克隆 序列分析 H5N1 NS基因