科研产出
特克赛尔羊*阿勒泰羊F2绵羊肉质嫩度全基因组关联分析
《家畜生态学报 》 2024 北大核心
摘要：为了定位影响绵羊嫩度相关SNP位点及其重要候选基因，该研究选取462只特克赛尔羊×阿勒泰羊F2绵羊，其中公羔229只、母羔233只，所有试验羊均在统一条件下饲养至8月龄后进行屠宰，利用C-LM4嫩度仪对嫩度进行测定，利用Illumina绵羊高密度（600K）SNP芯片进行基因分型，使用GEMMA软件的MLM模型对嫩度性状进行全基因组关联分析。结果表明，经质控后，剩余613 178个SNPs位点用于全基因组关联分析，发现9个潜在SNPs位点与嫩度相关，分别分布在2、6、23、24号染色体上。根据基因生物学功能及相关研究文献，推测EREG、AREG、PDE1A基因参与肌肉再生、肌纤维形成等生物学过程，可作为影响嫩度的重要候选基因。研究结果可为利用分子生物学方法改良绵羊肌肉嫩度提供科学依据。
关键词： 嫩度 特克赛尔羊×阿勒泰羊 F2 候选基因 全基因组关联分析 SNP
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绵羊MyoG基因多态性与胴体体尺性状的相关性分析
《草食家畜 》 2021
摘要：MyoG基因是对与产肉性状相关的重要候选基因之一。筛选MyoG基因与胴体体尺性状相关的遗传变异分子标记,对开展肉用生产性状分子选育具有重要的意义。本研究以特克塞尔×哈萨克横交F2代绵羊为实验群体,进行MyoG基因的SNPs多态性与胴体体尺性状之间的相关性分析。首先,随机选择50只特哈横交F2代绵羊,采用DNA双向测序技术筛选MyoG基因单核苷酸多态位点（SNPs）,得到6个SNP位点。然后,采用Sequenom MassARRAY○RSNP检测方法对384只绵羊MyoG基因6个SNPs进行分型。并将得到434只绵羊的6个SNPs基因型与其胴体重、胴体长、胸宽、肩宽、胸深、臀宽和踝骨宽7个胴体性状进行关联分析结果显示MyoG基因rs407552631、rs40016030、rs600781279和rs410212255 4个SNPs与胴体体尺性状相关,它们均位于内含子区域。其中,rs600781279中的GG和AG与个体踝骨宽显著相关;rs407552631中的GT和TT与胴体长、肩宽、臀宽和踝骨宽显著相关;rs410212255中的GA和GG与胸深显著相关;rs400160301中的GA与胴体长、臀宽和踝骨宽显著相关,AA与胴体长、肩宽、胸深、臀宽和踝骨宽显著相关,GG与肩宽、胸深和臀宽显著相关。本研究为今后绵羊胴体性状分子选育提供了参考。
关键词： MyoG基因 特哈杂交F2代 SNP 胴体性状 相关性分析
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西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析
《中国畜牧兽医 》 2020 北大核心
摘要：试验旨在探索WNT4和HOXC13基因多态性及其对西藏绒山羊绒毛纤维直径性状的影响,寻找与西藏绒山羊绒毛纤维直径性状相关的分子标记。以380只1岁西藏绒山羊群体为研究对象,利用混池DNA直接测序法检测WNT4和HOXC13基因的SNP,利用飞行时间质谱技术对SNP分型,利用SAS 9.1软件中最小二乘方差模型对SNP位点与绒毛平均纤维直径、纤维直径标准差、纤维直径变异系数进行关联分析。结果表明,WNT4基因第3外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP1和SNP2),HOXC13基因第2外显子区域检测到2个SNPs位点(SNP3和SNP4),均处于中度多态(0.25
关键词： 西藏绒山羊 WNT4基因 HOXC13基因 纤维直径 SNP 遗传效应
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新疆绵羊SNP数据库系统的设计与实现
《农业网络信息 》 2014
摘要：在当前生物信息学的研究过程中,通过对生物SNP数据的研究,可以了解生物的进化和发展过程,并找到影响其生长的基因。本文基于新疆绵羊SNP数据进行研究与设计,依据绵羊SNP数据的特性和系统要求,实现了新疆绵羊SNP数据库系统,为研究绵羊的科学工作提供了平台。
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牛DES基因的SNPs检测
《西北农业学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：设计了6套引物对利木赞(Limousin)和娟姗(Jersey)两个牛品种杂交一代的3头公牛进行DES基因的PCR扩增和测序,除引物4外均获得扩增产物,并在引物1扩增产物的上、下游及引物2扩增产物的上游序列的非编码区中各发现一个SNP,分别为SNP1(A/G)、SNP2(C/T)和SNP3(T/G)。同时测得公牛1、2、3的SNP1、SNP2、SNP3的基因型分别为A/A、A/G、A/G,C/C、C/C、C/T,T/G、G/G、G/G。
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