科研产出
苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建
《中国畜牧杂志 》 2022 北大核心
摘要：为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络.结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接.通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能.通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径.筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因.通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博美利奴羊毛囊发育的分子作用机制进行系统性挖掘.
关键词： miRNA lncRNA mRNA 毛囊发育 调控网络 苏博美利奴羊
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干旱胁迫下新疆野生沙生冰草的银染mRNA差异显示分析
《草食家畜 》 2010
摘要：运用非同位素银染mRNA差异显示方法,分析新疆野生沙生冰草抗旱基因表达差异。用10%(-1.0Mpa)PEG-6000溶液处理三叶一心期冰草,以叶片mRNA为模板采用锚定引物和随机引物组合,进行反转录差异显示PCR扩增,经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后用银染方法差异显示DNA条带,在直观下,从凝胶中回收差异带并进行再扩增,2%琼脂糖电泳得到了DNA的单一条带。通过分离与冰草抗旱性状相关的基因片段,为进一步从分子水平上认识冰草抗旱机理、进行抗旱相关基因的遗传操作奠定基础。
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