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资源类型: 中文期刊
关键词:microarray(模糊匹配)
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34份玉米种质材料的亲缘关系分析

草原与草坪 2018 CSCD

摘要:使用56K的基因芯片对34份玉米种质资源进行基因组水平上的分子鉴定。34份玉米种质材料在遗传结构上可以分为籽粒玉米种质和青贮玉米种质两种类型,大部分未知种质的遗传结构中青贮种质的遗传比例相对较大。通过亲缘关系分析发现种质材料亲缘关系较远的前5个种质材料分别为27(-5.000 64)>2(-3.300 79)>25(-1.475 92)>18(-1.352 37)>15(-1.217 94)。有20对种质材料间存在较大的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.2以上,25对种质材料间存在一定的亲缘关系,其亲缘关系系数在0.1~0.2。大部分未知青贮种质在遗传结构上具有较大的青贮种质遗传比例,是潜在的青贮玉米种质创新材料;种质材料27、2、25、18、15的亲缘关系较远。

关键词: 青贮玉米 基因芯片 遗传结构 亲缘关系

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表达谱芯片技术在动物胚胎发育研究中的应用进展

草食家畜 2013

摘要:基因表达谱芯片基因芯片中应用最广泛,具有灵敏、高效、平行化、高通量等优点,可检测胚胎发育过程中成千上万个基因的表达情况,绘制基因表达图谱,筛选特异性表达基因,从而揭示胚胎发育过程在基因水平上的本质。近年,利用表达谱芯片技术检测胚胎发育不同时期中miRNA的表达情况取得一定进展,这对全面研究胚胎基因组激活、胚胎发育阻滞等问题具有重要意义,本文对此进行综述。

关键词: 表达谱芯片 动物 胚胎发育

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不同羊毛纤维直径细毛羊皮肤组织差异表达基因研究

畜牧兽医学报 2013 北大核心 CSCD

摘要:为了筛选不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织中的差异表达基因,本研究利用Agilent公司绵羊表达谱芯片和Affymetrix公司牛表达谱芯片对不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织mRNA进行了芯片杂交;运用Sig-nificance Analysis of Microarrays(SAM)法对基因表达谱进行了差异分析;并通过分子注释系统平台(MAS3.0)对差异表达基因进行了功能富集类分析和调控通路分析;通过实时定量PCR对部分差异表达基因进行了验证。芯片试验共检测到267个差异表达的基因,其中上调基因106个,下调基因161个。Kegg和GO分析表明,参与细胞凋亡、增殖及分化、蛋白质代谢、Wnt信号通路以及羊毛角蛋白结构等生物学过程的多个基因表达水平发生了显著变化。所验证的差异表达基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致。结果表明,不同被毛纤维直径的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差别,这些基因的不同表达可能通过改变皮肤毛囊和羊毛分化过程影响被毛纤维直径。这些基因的发现将为进一步筛选影响羊毛纤维直径性状的重要候选基因/分子标记提供研究基础。

关键词: 细毛羊 纤维直径 基因表达 基因芯片

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