科研产出
绵羊小卵泡与中卵泡转录组差异特征分析
《江苏农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：卵泡的选择和发育过程涉及到卵泡内多种基因表达的变化和调控。绵羊卵泡的选择和发育过程与卵泡直径变化密切相关。以绵羊健康小卵泡(1~2 mm)和中卵泡(3~4 mm)为材料,进行RNA测序,分析小卵泡发育至中卵泡过程转录组水平变化特征。在分子功能上显著变化的基因主要涉及酶活性的调节和离子结合;在细胞组分上显著变化的基因主要涉及细胞外基质和质膜蛋白;在生物学过程上显著变化的基因主要涉及细胞增殖的正调控、细胞通讯、免疫和刺激反应等过程。KEGG分析差异基因富集的通路主要是补体和凝血级联反应,吞噬小体,细胞因子-细胞因子受体相互作用,TGF-β信号通路和轴突导向等。从小卵泡到中卵泡表达上调的有脂代谢相关基因(APOA1、APOD、APOE),胰岛素样生长因子路径基因(IGFBP1、IGFBP7),肿瘤生长因子beta途径基因(INHBA),核心蛋白多糖基因(DCN),血管发生基因(MGP),跨膜4超家族成员1基因(TM4SF1),胞外基质重建基因(MMP1、MMP13),五聚素3基因(PTX3),金属蛋白酶组织抑制剂1基因(TIMP1)。从小卵泡到中卵泡表达下调的主要有转录因子C-FOS、EGR1、FOSB和线粒体编码的脱氢酶家族基因MT-ND1、MT-ND5、MT-ND6等。这些基因的表达变化表明绵羊卵泡的选择过程可能涉及到IGF和TGFb通路的抑制,脂代谢、血管生成的增强以及细胞增殖能力下降等生物过程。
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