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绵羊TGFβ2基因及其剪切体的克隆与生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈磊 1 ; 倪文浩 1 ; 李雯雯 1 ; 李欣毅 1 ; 李文蓉 1 ;

作者机构: 1.新疆畜牧科学院生物技术研究所农业部草食家畜繁育生物技术重点开放实验室自治区重点实验室;新疆生产建设兵团第二中学

关键词: 绵羊;TGFβ2;克隆;编码区;生物信息学

期刊名称: 西北农业学报

ISSN: 1004-1389

年卷期: 2018 年 07 期

页码: 929-937

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在克隆绵羊TGFβ2(Transforming growth factor-β2)基因CDS,解析其序列及编码蛋白的生物学特性,为绵羊生产利用提供理论基础。采用PCR技术克隆获得TGFβ2基因的CDS,并进行生物信息学分析。结果表明:绵羊TGFβ2基因的CDS长度为1 329bp,编码442个氨基酸;其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2由于CDS部分缺失分别编码331和414个氨基酸。绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2编码蛋白的理论等电点分别为8.74、7.60和8.82,均存在1个信号肽和1个跨膜结构域,由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成;序列同源性分析发现,绵羊TGFβ2基因编码区的核苷酸和氨基酸序列与其他哺乳动物同源性较高,进化树分析表明,绵羊TGFβ2氨基酸序列与人类的进化关系较近,与斑马鱼较远;细胞定位分析表明TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2主要在细胞外基质中发挥作用,调控下游靶基因的表达。获得绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2完整的CDS,与TGFβ2转录本相比,TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2分别缺失111和28个氨基酸序列,其可能通过与TGFβ2转录本不同的分子调控机制发挥重要的生物学作用。

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