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新吉细毛羊皮肤组织均一化全长cDNA文库的质量评价

文献类型： 中文期刊

作者： 詹振宏 1 ; 黄锡霞 1 ; 田可川 2 ; 吴伟伟 2 ; 哈尼克孜·吐拉甫 2 ; 田月珍 1 ; 马依拉·吐尔逊 1 ; 艾买提·买买提 1 ; 何丽 1 ;

作者机构： 1.新疆农业大学动物科学学院

2.新疆畜牧科学院畜牧研究所

关键词： 新吉细毛羊;cDNA文库;质量评价;ESTs序列分析

期刊名称： 新疆农业大学学报

ISSN： 1007-8614

年卷期： 2013 年 36 卷 04 期

页码： 269-274

收录情况： 北大核心

摘要： 通过对已构建新吉细毛羊皮肤组织的均一化全长cDNA文库进行活化,在此基础上进行EST生物信息学分析研究,期望能发现影响细毛羊羊毛性状的主效基因或相关基因。运用菌落PCR、菌液PCR、质粒快速鉴定3种方法对cDNA文库进行评价,通过测序,在NCBI上BLASTn搜索、比对及运用DNAstar等软件进行分析。初步鉴定的结果:cDNA文库的库容量(滴度)为1.57×106 pfu/mL,菌落PCR、菌液PCR阳性克隆的小片段率在80%~90%,克隆的片段大小在0.6~2.0kb,cDNA在300~500bp,而质粒快速鉴定的在90%,克隆的片段载体带大小3.5~5.0kb。质粒快速鉴定的效果好于其他两种方法,耗时相对短,同时小片段率高;cDNA文库保存完好,符合基因文库的质量要求,有足够大的库容量来保证筛选目的基因。通过对筛选的阳性克隆5’端随机测序,随后获得可读序列169条,经过相关生物信息查询之后,发现其中可能含有完整基因。

  • 相关文献

[1]利用SMART技术构建新吉细毛羊皮肤组织全长cDNA文库. 吴茜,田可川,刘武军,张艳花,吴伟伟. 2010

[2]非遗传因素对新吉细毛羊主要经济性状的影响. 关鸣轩,李进龙,杨存明,魏趁,陈雪艳,杜桂琼,徐新明,付雪峰,佀博学,田可川,黄锡霞. 2020

[3]非遗传因素对超细型细毛羊初生重的影响. 杨存明,张漫,关鸣轩,魏趁,李进龙,杜桂琼,陈雪艳,邓亚迪,黄锡霞,田可川. 2022

[4]上饶地区武夷山百花蜜的质量安全评价研究. 李瑞丽,尹德凤,严寒,昌晓宇,温显利,张霞. 2018

[5]新疆乌昌地区草地资源评价及草地产值计算方法. 任玉平. 2008

[6]利用DDRT-PCR技术筛选新疆超细型细毛羊毛用性状相关基因. 劳荃蘅,黄锡霞,田可川,徐新明,贺三刚,汤存伟. 2009

[7]新吉细毛羊皮肤组织均一化全长cDNA文库的构建及其ESTs的生物信息学分析. 吴茜,黄锡霞,田可川,刘武军,张艳花,吴伟伟,邵勇刚. 2011

[8]细粒棘球绦虫免疫相关抗原基因的筛选及原核表达. 刘原源,安红燕,杨爽,王晓岑,宫鹏涛. 2016

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