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新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 袁萍 1 ; 闫丽辉 2 ; 成进 1 ; 汪萍 1 ; 柏庆 1 ; 李延涛 1 ;

作者机构： 1.新疆天康畜牧生物技术股份有限公司

2.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

关键词： 新城疫病毒;F基因;克隆;序列分析

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2009 年 30 卷 03 期

页码： 50-54

收录情况： 北大核心

摘要： 应用RT-PCR分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白(F)基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中。经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行分析和比较。序列分析结果表明,所获得的3个分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%。三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1bp～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明,QH3株NDV为基因Ⅷ型,A4株NDV为基因Ⅵ型,HLJ株NDV为基因Ⅸ型。

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