文献类型： 中文期刊
作者： 李金娜 1 ; 苗书魁 1 ; 马文戈 1 ; 魏玉荣 1 ; 汪萍 1 ; 夏俊 1 ; 陆桂丽 1 ; 米晓云 1 ; 沙依兰·卡依扎 1 ; 王延 1 ; 魏婕 1 ; 黄炯 1 ;
作者机构： 1.新疆农业大学动物医学学院;新疆畜牧科学院兽医研究所(新疆畜牧科学院动物临床医学研究中心)
关键词： 口蹄疫病毒;基因组;3'末端;Poly(A)
期刊名称： 新疆农业科学
ISSN： 1001-4330
年卷期： 2018 年 55 卷 11 期
页码： 2150-2156
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】扩增口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)O/Akesu/58 CE39A株基因组3'末端序列,并对其核苷酸序列进行分析,为FMDV反向遗传学研究奠定基础。【方法】采用普通PCR法和3'RACE法扩增FMDV基因组3'末端序列,利用分子生物学软件对该序列进行分析。【结果】扩增了口蹄疫病毒基因组3'末端序列,3'UTR长98 nt,Poly(A)长度不同(19、23、24、25、27、29、43)。3'UTR序列二级结构含有2个茎环结构,分别位于8 101～8 140和8 146～8 190 nt。O/Akesu/58 CE39A株3'UTR序列与参考毒株O/MAY/3/2014(GenBank登录号:KY322672)和O/IND26(54)/2014(GenBank登录号:KJ825807)的核苷酸序列同源性最高,均为89.8%。【结论】普通PCR法和3'RACE法均可扩增出3'末端序列。同一毒株的亚克隆,其Poly(A)长度与基因扩增时所用方法有关。不同毒株的Poly(A)长度不同,可能是毒株本身属性,也有可能是由扩增方法不同造成。Poly(A)要么扩增成功后其长度不同,要么扩增失败。失败的原因可能是3'末端结构复杂,难于扩增。
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