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西藏绒山羊羊绒细度候选基因筛选及其chi-miR-105a靶基因的验证

文献类型： 中文期刊

作者： 刘文娜 1 ; 陆庆伟 1 ; 索朗达 1 ; 宋伟杰 1 ; 吴翠玲 1 ; 付雪峰 1 ;

作者机构： 1.新疆农业大学动物科学学院;新疆畜牧科学院畜牧研究所/新疆绒毛用羊遗传育种与繁殖实验室;西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所;青岛农业大学动物科技学院;新疆师范大学生命科学学院中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心/新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室

关键词： 西藏绒山羊;多组学联合分析;chi-miR-105a;ETV6

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2023 年 09 期

页码： 117-127

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究西藏绒山羊羊绒细度，以及了解相关候选基因对绒山羊产绒性能的影响，本研究对筛选chi-miR-105a靶基因进行验证，以西藏绒山羊为研究对象，联合RNA测序数据和蛋白质组学数据，筛选与羊绒细度相关的关键候选基因，并通过实时荧光定量和双荧光素酶报告基因试验对候选基因进行调控作用验证。结果表明：1)通过转录组和蛋白组数据整理得到384个DE mRNAs, 12个DE miRNAs和29个DEPs。通过多组学联合分析发现CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B基因与羊毛细度相关。2)通过DEG-DE miRNA互作网络图发现chi-miR-105a与靶基因ETV6和PIP5K1B均在网络当中出现。因此对该调控因子进行验证和分析，根据靶基因表达水平试验发现转染chi-miR-105a mimics后引起毛乳头细胞中ETV6基因的mRNA表达显著降低(P<0.001),而PIP5K1B基因的表达量均无显著变化。3)通过双荧光素酶报告基因试验表明，过表达chi-miR-105a后，ETV6酶活性显著降低，即chi-miR-105a可与ETV6的3′UTR区结合。综上，通过多组学联合分析筛选出与羊毛细度相关基因CXCL10、SRC、CXCL9、FOS、ETV6、GMPS和PIP5K1B。通过双荧光素酶报告基因进行chi-miR-105a与其预测靶基因ETV6和PIP5K1B的靶标验证，确定chi-miR-105a是ETV6潜在的调控因子，本研究为加快优质绒山羊新品种(系)的培养提供理论依据。

  • 相关文献

[1]西藏绒山羊WNT4和HOXC13基因对绒毛纤维直径性状的遗传效应分析. 吴玉江,付雪峰,索朗达,巴贵,德吉,次仁德吉,宋天增,田可川. 2020

[2]不同绒细度的西藏绒山羊皮肤组织miRNA分析与鉴定. 付雪峰,赵冰茹,索朗达,巴贵,德吉,阿旺措吉,吴玉江,田可川. 2021

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