您好，欢迎访问新疆畜牧科学院 机构知识库！

细毛羊LAMB1基因外显子多态性及其与羊毛纤维直径的关联性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵冰茹 1 ; 黄锡霞 2 ; 田可川 3 ; 付雪峰 3 ; 徐新明 3 ;

作者机构： 1.新疆农业大学动物科学学院新疆畜牧科学院

2.新疆农业大学动物科学学院

3.新疆畜牧科学院

关键词： DNA混池;重测序;LAMB1基因;SNPs

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2016 年 43 卷 09 期

页码： 2401-2411

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在研究LAMB1基因外显子在细毛羊中的多态性及其与羊毛纤维直径的关联性。基于DNA池重测序技术获得的SNPs数据,共筛选LAMB1基因外显子区域20个SNPs,利用直接测序法、PCR-SSCP及生物信息学软件对10个错义突变SNPs的准确性进行验证,利用SAS 8.1的GLM程序分析其对新疆巩乃斯种羊场育种核心群300只细毛羊的遗传效应及与被毛纤维直径的关联性。结果表明,20个SNPs中10个是同义突变SNPs;10个错义突变SNPs验证后7个发生错义突变,导致蛋白性质改变,3个呈假阳性。突变后LAMB1蛋白疏水性更强,预测是不可溶性蛋白。SNP5中TT基因型个体纤维直径显著高于TC和CC基因型个体(P<0.05),SNP9中GG和TT基因型个体纤维直径显著高于GT基因型个体(P<0.05)。虽然DNA混池全基因组重测序技术完整地检测到基因的SNPs,并将假阳性最小化,但还需要对结果进行验证。研究揭示LAMB1基因外显子多态性丰富,突变SNPs在外显子中分布不平衡,LAMB1基因SNP5(rs159769941)和SNP9(rs159769901)可以考虑作为影响细毛羊被毛纤维直径的有效遗传标记。

  • 相关文献

[1]BMP15基因上1个新的影响绵羊繁殖力的SNP位点. 李晓林,牛志刚,陈莹,塔纳普·别克,夏江涛,魏玉刚,史洪才,贾斌. 2017

[2]KAP16基因对细毛羊重要经济性状的遗传效应分析. 何军敏,黄锡霞,田可川,赵冰茹,柏妍,田月珍,徐新明,付雪峰. 2017

[3]吐鲁番黑羊MC1R基因序列分析研究. 於建国,陈童,刘明军. 2014

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：新疆畜牧科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台