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鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 米晓云 1 ; 吴建勇 1 ; 马文戈 1 ; 日孜瓦古·努尔东 2 ; 王琦 1 ; 盛肖刚 3 ; 黄炯 1 ; 魏玉荣 1 ;

作者机构: 1.新疆维吾尔自治区畜牧科学院兽医研究所

2.巴音郭楞职业技术学院

3.新疆维吾尔自治区动物卫生监督所

关键词: 鸽圆环病毒;全基因;序列分析

期刊名称: 塔里木大学学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 001 期

页码: 1-8

摘要: 采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)新疆株(命名为XJ1株)全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2 031 bp,存在ORF V1(41~994 nt)、ORF C1(1 166~1 981 nt)、ORF C2(410~790 nt)、ORF C3(2~292 nt)和ORF C4(739~984 nt)5个阅读框,5’端和3’端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt。XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2%~94.9%,其中与GF17和GH1834的同源性最高(均为94.9%),基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子"ATG"分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近。鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考。

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