鸽圆环病毒新疆株全基因组克隆与序列分析

米晓云; 吴建勇; 马文戈; 日孜瓦古·努尔东; 王琦; 盛肖刚; 黄炯; 魏玉荣; 《塔里木大学学报 》 2021

摘要：采用PCR扩增与基因序列测定方法从病死鸽肝组织扩增获得鸽圆环病毒（Pigeon circovirus,PiCV）新疆株（命名为XJ1株）全基因组序列,并对其基因组组成、结构及遗传进化关系进行分析,结果显示,XJ1株基因组全长为2 031 bp,存在ORF V1（41～994 nt）、ORF C1（1 166～1 981 nt）、ORF C2（410～790 nt）、ORF C3（2～292 nt）和ORF C4（739～984 nt）5个阅读框,5’端和3’端基因间隔区长度分别为90 nt和171 nt。XJ1与已报道的24株鸽圆环病毒全基因组序列同源性为87.2%～94.9%,其中与GF17和GH1834的同源性最高（均为94.9%）,基于基因遗传进化树显示,XJ1株与Cap蛋白起始密码子"ATG"分支中GF82、JF007及GH1834亲缘关系最近。鸽圆环病毒新疆株全基因组序列的分析为疫苗开发提供资料参考。

关键词： 鸽圆环病毒 全基因 序列分析