科研产出
新疆地区牛冠状病毒的分子流行病学调查
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：牛冠状病毒（bovine coronavirus, BCoV）是造成犊牛腹泻的主要病原之一。新疆养牛业发展迅速，国内外引入品种数量日益增多，BCoV感染呈上升态势，但对其流行现状与规律缺乏全面了解。本研究于2020—2022年对新疆南、北疆养牛业主产区BCoV感染的流行情况进行了两年跟踪调查，共采集犊牛腹泻粪样本652份，采用RT-PCR方法进行了BCoV检测。对分离鉴定到的毒株进行了遗传进化分析。结果发现，BCoV总阳性率23.93%（156/652）。BCoV感染呈季节性变化，冬季为主要感染季节，检出率高达50.85%。南疆地区BCoV发病率高于北疆地区。与奶用犊牛相比，肉用犊牛更易感染。遗传进化分析表明：本试验分离到的BCoV毒株暂命名为BCoV/China/XJ-CJ/2022,该毒株的S基因与2018年毒株MN982199.1进化关系最近，N基因与2018年毒株MK095169.1BCOV-China/SWUN/LN4/2018进化关系最近，M基因与2017年毒株MK095148.1 China/SWUN/SC1/2017进化关系最近，HE基因与2017年毒株MK095136.1 BCOV-China/SWUN/SC2/2017进化关系最近。使用软件分析BCoV/China/XJ-CJ/2022与其它国家出现的BCoV毒株之间未出现基因重组现象。经5个结构蛋白的核苷酸和氨基酸相似性分析，发现其基因依然与中国国内本土毒株FJ938064.1＿E-AH187-TC相似度最高，分别最低达到91.50%和96.70%。调查结果表明，BCoV在新疆规模化牛场呈现出的季节、地域和品种间的感染差异性可为精准防控策略的制定提供数据支撑。
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新疆畜间布病分子流行病学特征分析
《新疆农业科学 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：【目的】新疆畜间布病流行株的流行病学特征,为新疆制定布病综合性防控措施提供科学依据和技术支撑。【方法】应用AMOS-PCR和MLVA-16方法对新疆畜间30株布鲁菌进行分析鉴定,将测定结果与http://mlva.u-psud.fr数据库提供的国内布鲁菌分离株的数据进行比较,结合软件Bionumerics进行聚类分析。【结果】30株布鲁菌中4株为牛种布鲁菌,26株为羊种布鲁菌。MLVA-16聚类分析结果表明,新疆地区30株布鲁菌可被分为10大基因群(A～J群)22个基因型,新疆地区流行的布鲁菌存在丰富的基因多态性。【结论】MLVA方法可对布鲁菌生物型和株间差异有很高的鉴别力,为布病疫情传染源的追踪和流行株的溯源进化关系提供科学依据。
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