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新疆地区牛冠状病毒的分子流行病学调查

文献类型: 中文期刊

作者: 王梦娇 1 ; 蒋倩 1 ; 马学军 2 ; 夏瑞阳 1 ; 郭雪萍 1 ; 孙磊 1 ; 钟旗 3 ; 马雪连 1 ; 姚刚 1 ;

作者机构: 1.新疆农业大学动物医学学院

2.新疆昌吉市二六工镇农业(畜牧业)发展服务中心

3.新疆维吾尔自治区畜牧科学院兽医研究所

关键词: 牛冠状病毒;分子流行病学;遗传进化分析

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2023 年 012 期

页码: 5125-5133

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 牛冠状病毒(bovine coronavirus, BCoV)是造成犊牛腹泻的主要病原之一。新疆养牛业发展迅速,国内外引入品种数量日益增多,BCoV感染呈上升态势,但对其流行现状与规律缺乏全面了解。本研究于2020—2022年对新疆南、北疆养牛业主产区BCoV感染的流行情况进行了两年跟踪调查,共采集犊牛腹泻粪样本652份,采用RT-PCR方法进行了BCoV检测。对分离鉴定到的毒株进行了遗传进化分析。结果发现,BCoV总阳性率23.93%(156/652)。BCoV感染呈季节性变化,冬季为主要感染季节,检出率高达50.85%。南疆地区BCoV发病率高于北疆地区。与奶用犊牛相比,肉用犊牛更易感染。遗传进化分析表明:本试验分离到的BCoV毒株暂命名为BCoV/China/XJ-CJ/2022,该毒株的S基因与2018年毒株MN982199.1进化关系最近,N基因与2018年毒株MK095169.1BCOV-China/SWUN/LN4/2018进化关系最近,M基因与2017年毒株MK095148.1 China/SWUN/SC1/2017进化关系最近,HE基因与2017年毒株MK095136.1 BCOV-China/SWUN/SC2/2017进化关系最近。使用软件分析BCoV/China/XJ-CJ/2022与其它国家出现的BCoV毒株之间未出现基因重组现象。经5个结构蛋白的核苷酸和氨基酸相似性分析,发现其基因依然与中国国内本土毒株FJ938064.1_E-AH187-TC相似度最高,分别最低达到91.50%和96.70%。调查结果表明,BCoV在新疆规模化牛场呈现出的季节、地域和品种间的感染差异性可为精准防控策略的制定提供数据支撑。

  • 相关文献

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