您好,欢迎访问新疆畜牧科学院 机构知识库!

蓝舌病新疆分离株VP7蛋白编码基因序列分析及一步法RT-PCR方法的建立

文献类型: 中文期刊

作者: 马晓菁 1 ; 谷文喜 1 ; 叶锋 1 ; 刘帅 1 ; 刘丽娅 1 ; 谢彩云 1 ; 钟旗 1 ; 易新萍 1 ;

作者机构: 1.新疆维吾尔自治区畜牧科学院兽医研究所

关键词: 蓝舌病;VP7蛋白;RT-PCR

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2024 年 001 期

页码: 253-259

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分析蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列,建立蓝舌病新疆分离株一步法RT-PCR方法,为新疆BTV分子流行病学调查及防控提供技术支持。【方法】采用二代测序技术获得新疆分离株S7基因序列,登陆GenBank对序列进行同源性Blast比对,用软件MEGA 5.0分析序列差异,根据蓝舌病新疆分离株编码VP7蛋白S7基因保守序列,运用软件Oligo6.0设计引物,对蓝舌病新疆分离株S7基因进行RT-PCR扩增,并验证该方法的特异性及敏感性。【结果】蓝舌病中国新疆分离株编码VP7蛋白S7基因序列与哈尔滨报道BTV分离株S7基因片段相似度较高为89.64%,与中国云南报道BTV-29型分离株、蒙古国BTV分离株S7基因片段相似度分别为87.49%和87.39%;与德国BTV分离株S7基因片段相似度为80.70%,其余均无同源性序列。中国新疆分离株S7基因片段序列与4条同源序列间存在26处核苷酸差异,9处氨基酸差异。【结论】建立的蓝舌病中国新疆分离株S7基因片段一步法RT-PCR方法具有良好的特异性,仅BTV中国新疆分离株扩增获得目的条带,该方法的敏感性为4.0×103 copies/mL。

  • 相关文献

[1]新疆地区蓝舌病病毒的分离鉴定及编码VP5外壳蛋白的基因序列分析. 马晓菁,薛晓波,叶锋,刘丽娅,古丽扎提·塔力甫汗,谷文喜,易新萍. 2022

[2]新疆地区羊蓝舌病流行病学调查与分析. 舒展,刘帅,加帕尔·哈斯木,宋迎春,薛新梅,叶锋,马晓菁,钟旗,马俊杰,谷文喜. 2017

[3]新疆部分地区三种重要牛羊虫媒病毒病流行情况调查. 努尔拜合提·努尔旦,张婷,刘帅,丁梦玥,靳红娟,陈雅璐,张悦,谷文喜. 2018

[4]2012年新疆蓝舌病血清学调查及区间分布. 王玉,谷文喜,石保新,易新萍,张玲,姚刚,叶锋,马小菁,钟旗. 2014

[5]A gene family from Echinococcus granulosus differentially expressed in mature adult worms. Zhang, WB,Li, J,You, H,Zhang, ZZ,Turson, G,Loukas, A,McManus, DP. 2003

[6]用半定量RT-PCR法检测BⅢB4基因在绵羊皮肤组织中的mRNA表达. 劳荃蘅,黄锡霞,田可川,徐新明,贺三刚,张廷虎,吴伟伟,刘祯. 2009

[7]苏博美利奴羊S100A11基因序列分析及表达研究. 付雪峰,刘春洁,黄锡霞,石刚,徐新明. 2016

[8]新吉细毛羊角蛋白的EST筛选及表达研究. 刘春洁,付雪峰,田可川,黄锡霞,徐新明,詹振宏,于丽娟. 2015

[9]新疆某地区犬流感病毒血清学及病原学调查. 米晓云,盛肖刚,吴建勇,汪萍,杨学云,魏玉荣. 2021

[10]Hoxc13基因在苏博美利奴羊胎羔生长发育期不同组织中的表达分析. 杜建文,何军敏,陈春艳,田月珍,徐新明,付雪峰,哈尼克孜·吐拉甫,赵冰茹,朱桦,黄锡霞,田可川. 2019

[11]鉴别蓝舌病病毒血清29型RT-PCR与qRT-PCR方法的建立与应用. 李占鸿,宋子昂,谷文喜,李华春,钟旗,杨振兴,李卓然,廖德芳,杨恒. 2022

[12]狂犬病病毒SRV_9株N、P、G和L蛋白基因的克隆及表达载体构建. 魏玉荣,易忠,符子华,马素贞,王晓萍,简子健,魏婕,王海烽,朱晶晶. 2009

[13]中国美利奴羊(新疆型)皮肤组织GAPDH基因实时荧光定量PCR方法的建立. 田月珍,黄锡霞,狄江,田可川,吴伟伟,徐新明,哈尼克孜,付雪峰,张艳花,马依拉,艾买提. 2012

[14]禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4(H5N1)的PB1、PB2和PA基因测序及进化分析. 汪萍,沙依兰古丽,符子华,盛卓君,巴哥得力,陆桂丽,成进. 2008

[15]绵羊卵丘细胞直径与卵母细胞质量的相关性. 古丽米热·阿布都热依木,吴阳升,林嘉鹏,汪立芹,张利,蒋香菊,杨楠,唐淑红,黄俊成. 2014

[16]2016年新疆尉犁县羊蓝舌病的诊断. 丁梦玥,马晓菁,叶锋,刘帅,薛新梅,宋迎春,加帕尔·哈斯木,易新萍,刘丽娅,孟肖潇,马俊杰,谷文喜,钟旗. 2018

[17]新疆蓝舌病病毒的分离及初步鉴定. 张玲,宋迎春,加帕尔·哈斯木,薛新梅,王玉,谷文喜,易新萍,马晓菁,钟旗. 2016

[18]禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4的NP基因序列分析. 夏俊,沙依兰古丽,汪萍,成进,符子华,巴格德力,盛卓君,李曦,崔尚金. 2008

[19]新疆部分地区发病猪场猪瘟病毒的诊断. 范玉娟,蔡扩军,徐敏,刘丽娅,汪萍,成进,陆桂丽. 2015

[20]不同羊毛纤维直径细毛羊MYL6基因克隆及差异表达研究. 付雪峰,黄锡霞,刘春洁,徐新明,张艳花,吴伟伟,于丽娟,石刚,田可川. 2016

作者其他论文 更多>>