科研产出
基于F基因的鸽新城疫病毒分子特征分析
《现代畜牧兽医 》 2023
摘要：试验旨在了解鸽新城疫病毒流行株的分子特征,利用MEGA7.0、Lasergene7.0软件对2020-2022年新疆和田地区规模化养鸽场流行病学调查阳性样品进行了鸽新城疫病毒F基因的测序和序列分析.结果显示,6株F基因属于Ⅵ.2.1.1.2.2基因亚型,F蛋白裂解位点序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与基因Ⅱ型疫苗株La Sota株、HB1株、VG/GA株、Clone30株及基因Ⅲ型Mukteswarz株的核苷酸同源性为83.5%~85.7%,与甘肃、宁夏鸽新城疫核苷酸同源性为97.3%~99.5%.6株F蛋白融合肽区均有两处氨基酸突变(V121I、A132S),HRa区均有1处氨基酸突变(V179I),NDV/PIGEON/XJHT/802/2022/F在HRb、HRc和跨膜区还有1~2个氨基酸突变.研究表明,该地区鸽新城疫病毒遗传相对稳定,变异持续存在,定期监测与分析鸽新城疫病毒分子流行特征十分必要.
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新疆野生北山羊小反刍兽疫病毒分子特征
《中国动物检疫 》 2021
摘要：为了解新疆野生北山羊小反刍兽疫病毒（peste20des20petits20ruminants20virus,PPRV）的分子特征,根据GenBank公布的PPRV基因组序列设计并合成引物,采用RT-PCR方法和基因测序技术获得病毒全基因序列,应用分子生物学分析软件,对分离的PPRV毒株进行序列分析。结果显示,本次分离的PPRV毒株（China/XJAKS/2017）属于基因IV型,基因组全长152095420nt,编码6种结构蛋白和2种非结构蛋白;在系统进化上,与国内新疆分离株China/XJBZ/2015、China/XJYL/2013同源率分别高达99.0%、99.6%,与国外的巴基斯坦和塔吉克斯坦分离株亲缘关系最近。结果表明,PPRV已经在家养动物与野生动物之间传播。结果提示,PPRV传入野生动物群为我国消除PPR带来极大困难,需加强我国边疆地区PPR免疫隔离带建设,并对野生动物PPRV分子流行病学特点进行追踪监测。
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单核细胞增生李斯特菌新型内化素lmo0549的分子特征及其表达
《江苏农业科学 》 2019 北大核心
摘要：应用PCR技术对单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)新型内化素lmo0549基因进行克隆和测序,并对其进行生物信息学分析;通过扩增获得Lmo0549蛋白氨基端抗原集中区序列,并将其亚克隆至pET-32a(+)表达载体,转入大肠杆菌中用异丙基硫代半乳糖苷(isopropyl β-D-thiogalactoside,简称IPTG)诱导表达,应用十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,简称SDS-PAGE)和蛋白质印迹法(western blot)鉴定重组蛋白的表达形式及其抗原特异性.序列分析结果表明,扩增得到的lmo0549基因全长为2 034 bp,编码677个氨基酸,其信号肽序列是前23个氨基酸,在Lmo0549蛋白氨基酸序列中,从N端到C端分别包括5个富含亮氨酸的重复基序(LRR)、1段PKD重复序列和1个WxL结构域;同时还存在N-联糖基化位点10个、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点14个、蛋白激酶C磷酸化位点15个.同源性分析显示,LM-SB5 lmo0549基因编码的蛋白氨基酸序列与标准株李斯特菌EGD-e,(NC003210.1)蛋白氨基酸序列的同源性为88.04%,且在单核细胞增生李斯特菌中具有较高的保守性.SDS-PAGE分析显示,表达的Lmo0549蛋白氨基端抗原集中区具有与理论值33.8 ku相符的分子质量;蛋白质印迹法分析表明,重组蛋白Lmo0549与LM阳性血清可发生特异性免疫反应,为进一步探讨Lmo0549在LM侵入宿主细胞的分子作用机制奠定了前期基础.
关键词： 单核细胞增生李斯特菌 内化素Lmo0549 克隆 分子特征 原核表达
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