科研产出
基于基因组信息估计中国美利奴羊羊毛纤维直径和弯曲性状的遗传参数
《中国畜牧兽医 》 2025 北大核心
摘要：[目的]利用基因组信息估计新疆巩乃斯种羊场中国美利奴羊周岁及成年羊羊毛纤维直径和弯曲性状遗传参数.[方法]对2022-2023年巩乃斯种羊场1 520只周岁羊、836只成年母羊进行全基因组重测序,收集系谱数据,利用OFDA等仪器测定羊毛平均纤维直径(MFD)、纤维直径标准差(FDSD)、纤维直径变异系数(FDCV)、直径<30μm纤维含量百分比(CF)、沿毛丛方向平均纤维直径标准差(APSD)、弯曲数(CN)、纤维平均曲率(MFC)和纤维弯曲度标准差(FCSD)8个性状,共计18 496条数据信息.分别基于系谱和基因组信息构建亲缘关系矩阵,建立多性状动物模型、利用ASREML软件采用平均信息最大似然法估计性状遗传力、遗传相关和表型相关.[结果]基于系谱信息估计的周岁和成年羊羊毛性状遗传力范围分别为0.066~0.859和0.088~0.782.基于基因组信息估计的周岁羊羊毛性状均为高遗传力性状(0.349~0.684),成年羊羊毛性状为中到高遗传力性状(0.125~0.941).其中,中国美利奴羊品种中测定的性状CF、APSD、MFC和FCSD的遗传力在周岁羊分别为0.445、0.403、0.684和0.635,属于高遗传力,在成年羊分别为0.776、0.125、0.471和0.624,属于中到高遗传力.周岁和成年羊基于基因组信息估计的MFD与 FDSD呈较高正遗传相关(P<0.01),与 CF呈较高的负遗传相关(P<0.01);MFC与FCSD呈较高正遗传相关(P<0.01).[结论]基于基因组信息估计出中国美利奴羊羊毛纤维直径和弯曲性状,周岁羊均为高遗传力,成年羊为中到高遗传力.周岁羊和成年羊CF-与 MFD间呈较高负遗传相关,MFC 与 FCSD间遗传相关性和表型相关性均最高.基于基因组信息估计遗传参数提高了准确性,为了解中国美利奴羊群体中纤维直径和弯曲性状变异,为进一步完善育种方案提供了借鉴.
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新疆褐牛分子生物学和组学研究进展
《中国牛业科学 》 2024
摘要：[目的]回顾与总结近十年新疆褐牛研究应用分子生物学技术和组学技术在遗传,育种,产品品质,消化道微生物和疾病方面的研究现状及进展,为新疆褐牛持续深入的研究提供参考.[方法]检索美国国立医学图书馆(NCBI PUBMED)数据库和中国知网(CNKI)数据库中与新疆褐牛研究相关的文献,收集到SCI文献 28 篇和中文文献 22 篇,共汇总分析50 篇文献.[结果]分子生物学研究的新疆褐牛经济性状基因包括:生长性状6 个基因,肉质性状7 个基因,泌乳性状10 个基因,抗病性状4 个基因.组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学,宏基因组学和DNA甲基化)研究了新疆褐牛的遗传进化,基因组选择育种,经济性状候选基因,消化道微生物组成和功能,抗乳房炎和抗呼吸道疾病的分子机理.[结论]新疆褐牛研究已进入组学时代,但相较于国内其他牛种起步较晚,文献数量较少,可借鉴和研究的空间比较大.应加强与内地省份科研院所的联合攻关,积极加入国内外有关牛组学的大型研究计划,利用其中的大数据资源和新算法或模型,深入挖掘新疆褐牛的遗传潜力和经济价值,加快科研成果转化,培育新疆褐牛新品系,在种业振兴方面做出应有的贡献.
关键词： 新疆褐牛 PCR 基因组 转录组 蛋白质组 代谢组 宏基因组 DNA甲基化
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口蹄疫病毒基因组3'末端序列扩增及分析
《新疆农业科学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】扩增口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)O/Akesu/58 CE39A株基因组3'末端序列,并对其核苷酸序列进行分析,为FMDV反向遗传学研究奠定基础。【方法】采用普通PCR法和3'RACE法扩增FMDV基因组3'末端序列,利用分子生物学软件对该序列进行分析。【结果】扩增了口蹄疫病毒基因组3'末端序列,3'UTR长98 nt,Poly(A)长度不同(19、23、24、25、27、29、43)。3'UTR序列二级结构含有2个茎环结构,分别位于8 101～8 140和8 146～8 190 nt。O/Akesu/58 CE39A株3'UTR序列与参考毒株O/MAY/3/2014(GenBank登录号:KY322672)和O/IND26(54)/2014(GenBank登录号:KJ825807)的核苷酸序列同源性最高,均为89.8%。【结论】普通PCR法和3'RACE法均可扩增出3'末端序列。同一毒株的亚克隆,其Poly(A)长度与基因扩增时所用方法有关。不同毒株的Poly(A)长度不同,可能是毒株本身属性,也有可能是由扩增方法不同造成。Poly(A)要么扩增成功后其长度不同,要么扩增失败。失败的原因可能是3'末端结构复杂,难于扩增。
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超细型细毛羊新品系AFLP技术体系的建立
《中国畜牧兽医 》 2008 北大核心
摘要：以超细型新吉细毛羊为研究对象,通过对AFLP技术体系的各项条件的优化,包括双酶切、连接、预扩增和选择性扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染,建立了适合于超细型细毛羊基因组多态性分析的AFLP技术体系。
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