科研产出
基于F基因的鸽新城疫病毒分子特征分析
《现代畜牧兽医 》 2023
摘要：试验旨在了解鸽新城疫病毒流行株的分子特征,利用MEGA7.0、Lasergene7.0软件对2020-2022年新疆和田地区规模化养鸽场流行病学调查阳性样品进行了鸽新城疫病毒F基因的测序和序列分析.结果显示,6株F基因属于Ⅵ.2.1.1.2.2基因亚型,F蛋白裂解位点序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与基因Ⅱ型疫苗株La Sota株、HB1株、VG/GA株、Clone30株及基因Ⅲ型Mukteswarz株的核苷酸同源性为83.5%~85.7%,与甘肃、宁夏鸽新城疫核苷酸同源性为97.3%~99.5%.6株F蛋白融合肽区均有两处氨基酸突变(V121I、A132S),HRa区均有1处氨基酸突变(V179I),NDV/PIGEON/XJHT/802/2022/F在HRb、HRc和跨膜区还有1~2个氨基酸突变.研究表明,该地区鸽新城疫病毒遗传相对稳定,变异持续存在,定期监测与分析鸽新城疫病毒分子流行特征十分必要.
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喀什地区部分鸽群新城疫病毒的检测及F基因片段序列分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2023 北大核心
摘要：为调查喀什地区鸽群新城疫病毒感染情况及流行毒株的分子流行病学特征，试验采集喀什地区部分鸽群中疑似新城疫病毒感染的病鸽口腔及泄殖腔拭子68份，首先采用胶体金检测法进行初筛，然后采用RT-PCR法对初筛阳性样品进行新城疫病毒F基因片段的检测，并将产物进行测序，接着采用qRT-PCR方法对RT-PCR结果进行验证，最后将测序结果进行BLAST比对、系统发育树构建、同源性分析和氨基酸序列分析。结果表明：68份样本中，有7份样本胶体金检测为阳性，有1份样本RT-PCR检测出目的条带，qRT-PCR检测结果与RT-PCR检测结果一致。测序结果经BLAST比对发现，阳性样本的F基因片段序列与NDV03-29毒株（GenBank登录号为DQ217694.1）和Behaira Equpt MR6 2012毒株（GenBank登录号为JX193771.1）的相似性最高，均为99.8%;经系统发育树构建和同源性分析发现，所检测到的毒株属于基因Ⅱ型，除了与Behaira Equpt MR6 2012和NDV03-029高度同源外，还与毒株La Sota（GenBank登录号为KU665482.1）的核苷酸相似性较高，与鸽源PPMV-1毒株Vladimir-687-05（GenBank登录号为JF824032.1）核苷酸相似性较低；氨基酸序列分析发现该毒株F0裂解位点的氨基酸序列为112GRQGRL117,与NDV弱毒株一致。说明喀什地区部分鸽群中存在基因Ⅱ型新城疫病毒弱毒株感染情况，在今后的养殖过程中需要进一步加强新城疫病毒的监测和防控。
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维药阿里红5种活性成分体外抗鸡新城疫病毒作用
《中国兽医学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：为了研究维药阿里红各活性成分抗鸡新城疫病毒(NDV)的活性,本试验分别提取了阿里红多糖、多酚、黄酮、生物碱、挥发油并测定其含量。通过MTT法测定阿里红各活性成分对鸡胚成纤维细胞的最大安全浓度。以3种加药方式将药物与NDV加入已制备好的鸡胚成纤维细胞上,即先加药后接种病毒,先接种病毒后加药,病毒和药物混合作用后加入,以检测各组分对NDV的阻断作用、抑制作用以及直接杀灭作用。结果表明,多糖、多酚、黄酮、生物碱、挥发油均有抗病毒活性,其中多糖对NDV的直接杀灭作用及抑制作用强于对NDV的阻断作用。多糖、多酚、黄酮、生物碱、挥发油在抑制作用下的病毒抑制率分别为49.12%,39.64%,42.45%,40.00%,18.59%;杀灭作用下的病毒抑制率分别为45.35%,35.71%,38.57%,35.71%,41.07%;阻断作用下的病毒抑制率分别为15.58%,8.57%,32.98%,43.11%,31.42%。综上可知,维药阿里红的活性成分多糖和生物碱的抗NDV活性较好,可以作为进一步研究的材料。
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5株禽新城疫病毒新疆分离株F基因序列测定与遗传进化分析
《中国畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要：从新疆乌鲁木齐市郊区养禽场发病禽群中分离到4株鸡源新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)和1株鸽源NDV。经血凝HA试验鉴定,NDV分离株均具有血凝性,5个毒株的血凝特性均可被NDV阳性血清所抑制,而不能被禽流感病毒(H5亚型与H9亚型)阳性血清抑制。本试验通过RT-PCR扩增了5株NDV全长F基因并进行了序列测定。序列分析表明,5株NDV的核苷酸序列分别为1662、1589、1676、1589和1662bp,均含有1个开放阅读框,分別编码553、528、553、520和553个氨基酸;根据基因裂解位点的氨基酸序列分析表明,鸡源XJ/10/08株属于强毒株,XJ/3/07株、XJ/7/07株、XJ/9/08株和XJ/11/08株属于弱毒株;同源性分析表明,5个NDV新疆分离株与LaSota疫苗株的核苷酸同源性在83.7%～99.8%之间,与TaiWan95株核苷酸同源性在84.7%～93.3%之间;遗传发育进化树分析表明,分离到的4个弱毒株与La-Sota、Clone30、B1、BEA-45在同一亚群,属基因Ⅱ型,强毒分离株与TaiWan95、广东株(GD-1-98)、江苏株(JS-5-1)在同一进化分支内,属基因Ⅶ型。
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新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析
《动物医学进展 》 2009 北大核心
摘要：应用RT-PCR分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白(F)基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中。经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行分析和比较。序列分析结果表明,所获得的3个分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%。三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1bp～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明,QH3株NDV为基因Ⅷ型,A4株NDV为基因Ⅵ型,HLJ株NDV为基因Ⅸ型。
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