焉耆马的DRA与DQA基因遗传多态性及其序列分析

于丽娟; 张艳花; 徐新明; 吴伟伟; 阿米妮古丽·阿不来孜; 田可川; 《中国畜牧杂志 》 2017 北大核心

摘要：采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测焉耆马ELA-DRA*exon2、ELADQA*exon2的基因型,并对不同等位基因进行测序,对其核苷酸与氨基酸序列进行分析。结果表明:焉耆马的ELA-DRA*exon2共检出4个等位基因;ELA-DQA*exon2共检出9个等位基因,通过核苷酸序列比对发现其中3个为新等位基因。ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的各等位基因序列分析结果表明,发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中。遗传多态性分析结果表明,焉耆马的ELA-DRA*exon2多态信息含量为0.4,属于中度多态。卡方检验结果表明,焉耆马在该ELA-DRA*exon2位点处于Hardy-Weinberg平衡(χ2>χ20.05)。本研究为马的抗病育种提供了理论基础。

关键词： 焉耆马 主要组织相容性复合体 DRA DQA PCR-SSCP