科研产出
PTPN11基因多态性及与细毛羊重要经济性状的关联分析
《新疆农业大学学报 》 2018
摘要：为分析中国美利奴羊(新疆型)PTPN11基因的多态性及与细毛羊重要经济性状的相关性,寻找可用于中国美利奴羊(新疆型)选育的分子遗传标记。本研究运用PCR-SSCP技术检测PTPN11基因的多态性,用SAS 8.1软件中的最小二乘方法分析PTPN11基因与羊毛性状的关联性。结果表明,PTPN11基因共检测到了AA、AB和BB 3种基因型,其基因型频率分别为0.28、0.52和0.20;A、B等位基因频率分别为0.54和0.46,A等位基因占优势。χ~2检验显示,PTPN11基因处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),PTPN11基因位点的多态信息含量为0.37,PTPN11基因在该群体中处于中等程度的遗传变异。不同基因型的个体对弯曲评分有显著影响(P<0.05),对其他性状均无显著影响(P>0.05)。
关键词： PTPN11基因 PCR-SSCP 细毛羊 关联分析
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焉耆马的DRA与DQA基因遗传多态性及其序列分析
《中国畜牧杂志 》 2017 北大核心
摘要：采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测焉耆马ELA-DRA*exon2、ELADQA*exon2的基因型,并对不同等位基因进行测序,对其核苷酸与氨基酸序列进行分析。结果表明:焉耆马的ELA-DRA*exon2共检出4个等位基因;ELA-DQA*exon2共检出9个等位基因,通过核苷酸序列比对发现其中3个为新等位基因。ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的各等位基因序列分析结果表明,发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中。遗传多态性分析结果表明,焉耆马的ELA-DRA*exon2多态信息含量为0.4,属于中度多态。卡方检验结果表明,焉耆马在该ELA-DRA*exon2位点处于Hardy-Weinberg平衡(χ2>χ20.05)。本研究为马的抗病育种提供了理论基础。
关键词： 焉耆马 主要组织相容性复合体 DRA DQA PCR-SSCP
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7个绵羊和7山羊品种DLX3基因3′非编码区803A>G突变的检测
《草食家畜 》 2015
摘要：DLX3基因3′非编码区803A>G突变与法国Lacaune绵羊高繁殖力密切相关座位FecL高度连锁。本研究采用PCR-SSCP方法在具有不同繁殖力的7个绵羊品种(湖羊、小尾寒羊、洼地绵羊、杜泊、陶赛特、特克塞尔、德国美利奴羊)和7个山羊品种(济宁青山羊、贵州白山羊、金堂黑山羊、成都麻羊、辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中检测DLX3基因803A>G突变,探究该突变与绵羊和山羊高繁殖力的关联性。结果表明这14个绵羊和山羊品种都不存在c.~*803A>G突变,提示DLX3基因的c.~*803A>G突变对这14个绵羊和山羊的繁殖力没有显著影响。
阿勒泰羊BMP15基因的多态性
《贵州农业科学 》 2014 北大核心
摘要：为寻找和筛选与羊繁殖力相关的遗传标记,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测BMP15基因在阿勒泰羊中的单核苷酸多态性。结果表明:在检测的92个阿勒泰羊个体中,BMP15基因在外显子1位点呈多态性,具有AA、AB和BB 3种基因型。阿勒泰羊AA基因型频率为0.695,AB基因型频率为0.120,BB基因型频率为0.185。该段DNA序列存在3个碱基缺失,这个突变导致野生型(AA)氨基酸序列上相应的10号氨基酸残基亮氨酸缺失,变为突变基因型BB,形成B1突变体;在阿勒泰羊的BMP15基因中未检测到B2和B4突变。
关键词： 阿勒泰羊 骨形态发生蛋白15基因 PCR-RFLP PCR-SSCP
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新疆褐牛催乳素(PRL)基因第4外显子多态性及其与泌乳性能的关联分析
《新疆农业大学学报 》 2013 北大核心
摘要：运用PCR-SSCP和测序技术分析了催乳素基因第4外显子在新疆褐牛群体中的遗传多态性,并运用SAS8.1统计软件对不同基因型与泌乳性能的关系进行了最小二乘分析。结果表明,PRL基因第4外显子发生了G8377C,A8398G两处突变,引起单链构象多态性,新疆褐牛群体中检测到AA、AB和BB 3种基因型,基因型频率分别为0.345,0.526,0.129,A、B等位基因频率分别为0.608,0.392;经最小二乘分析发现BB和AB基因型母牛的乳蛋白率显著高于AA基因型(P<0.05),AA基因型母牛的日产奶量显著高于AB基因型(P<0.05)。分析结果提示,PRL基因第4外显子上的碱基突变位点可能是影响新疆褐牛泌乳性能的重要位点。
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中国美利奴羊(新疆型)KRTAP9-2基因的多态性
《畜牧与兽医 》 2013 北大核心
摘要：KRTAP9-2基因是超高硫角蛋白相关蛋白基因家族中的一员,超高硫角蛋白相关蛋白基因家族在连接中间微丝角蛋白中可能起到重要作用。本文首次以418只中国美利奴羊(新疆型)为试验群体,采用PCR-SSCP技术和测序方法分析了KRTAP9-2基因的多态性。结果表明:在中国美利奴羊(新疆型)个体中出现AA、AB、BB、CC 4种基因型,其基因型频率分别为0.469、0.347、0.103、0.082;A、B、C 3种等位基因频率分别为0.683、0.276、0.041;测序分析发现KRTAP9-2存在C35A和C132G突变位点,35 bp、46 bp插入/缺失;经χ2检验,中国美利奴羊(新疆型)在KRTAP9-2位点上均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01),且该位点上呈现出中度的多态(PIC=0.384)。研究结果提示KRTAP9-2基因能够作为中国美利奴羊(新疆型)毛用性状的候选基因,以便为细毛羊分子育种提供理论依据。
关键词： 中国美利奴羊(新疆型) KRTAP9-2 PCR-SSCP
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哈萨克马的DRA与DQA基因的SSCP检测及序列分析
《新疆农业科学 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：【目的】了解哈萨克马ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的等位基因分布及其特性,为马的抗病育种提供理论基础。【方法】采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法检测哈萨克马ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的等位基因分布,并对不同等位基因的核苷酸与氨基酸序列进行分析。【结果】在47匹哈萨克马中,ELA-DRA* exon2有3个等位基因,其中两种等位基因在纯合子中被检出,另外一种等位基因在杂合子中被检出;ELA-DQA* exon2有7个等位基因,且都以纯合子被检出,通过核苷酸序列比对发现其中5个为新等位基因。【结论】ELA-DRA*exon2、ELA-DQA*exon2的各每位基因序列分析结果表明,发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中。
关键词： 哈萨克马 PCR-SSCP ELA-DRA*exon2 ELA-DQA*exon2 等位基因
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布鲁氏菌PCR鉴定方法的研究与应用
《中国人兽共患病学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：目的采用PCR、PCR-SSCP方法对布鲁氏菌进行快速鉴定,并对其种、型鉴别。方法分析已发表布鲁氏菌属、种、型基因序列,寻找出不同布鲁氏菌的种、型特异性碱基分布规律,设计特异性引物,用于布鲁氏菌属、种、型的鉴定;根据聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析原理,建立PCR-SSCP方法,用于区分牛种A19疫苗株与其他型布鲁氏菌。结果所建立的PCR方法能高效、准确鉴定出布鲁氏菌,并能对其种、型进行区分;PCR-SSCP方法可将A19疫苗株从其他型布鲁氏菌中区分出来。结论利用PCR、PCR-SSCP方法能快速、准确地进行布鲁氏菌属、种、型以及疫苗株A19的鉴别,且简便、可靠,便于临床应用。
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新疆良种驴DGAT2基因第3内含子PCR-SSCP多态性与体尺性状的相关性分析
《石河子大学学报(自然科学版) 》 2011
摘要：应用PCR-SSCP技术对新疆和田和喀什良种驴群体的DGAT2基因内含子3进行单核苷酸多态性检测和分析,探讨DGAT2基因作为候选基因影响新疆良种驴体尺性状的可能性。结果表明:DGAT2基因存在多态性,其第3内含子有两种等位基因A和B,存在AA和AB两种基因型,没有检测到BB基因型,其中AA基因型为优势基因型。AB型与AA型相比存在碱基发生A→G的突变,使赖氨酸突变为精氨酸。新疆和田良种驴AA与AB基因型个体相比,体高和胸围差异极显著(P<0.01),体长差异显著(P<0.05),AB型体高、胸围和体长高于AA型。新疆喀什良种驴AA与AB基因型个体相比,体高差异显著(P<0.05),AB型的体高、胸围和体长高于AA型。新疆喀什良种驴的体高、体长和胸围高于和田良种驴,差异极显著(P<0.01)。
关键词： 新疆良种驴 DGAT2基因 内含子3 PCR-SSCP 多态性
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济宁青山羊高繁殖力候选基因类固醇21-羟化酶基因(CYP21)的研究
《农业生物技术学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR-SSCP和聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术检测类固醇21-羟化酶基因(steroid 21-hydroxylase,CYP21)10个外显子在山羊(Capra hircus)低繁殖力品种(安哥拉山羊和内蒙古绒山羊)、中等繁殖力品种(波尔山羊)和高繁殖力品种(济宁青山羊)中的碱基变异,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明,10对引物中仅引物P10扩增片段存在多态性。对于P10扩增产物,在内蒙古绒山羊、波尔山羊和济宁青山羊中检测到AA、AB和BB基因型,在安哥拉山羊中检测到AA和AB基因型;测序分析发现,BB与AA基因型相比发生了A2789C、C2791A、G2818A、G2851C、G2852T和G2854A的突变,在第2821与2822位发生了两个碱基CG的缺失突变,导致426～448位共有19个氨基酸发生改变;济宁青山羊BB和AB基因型产羔数最小二乘均值分别比AA基因型的多0.81只(P<0.05)和0.47只(P<0.05),BB和AB基因型之间差异不显著(P>0.05)。研究结果初步表明CYP21基因的B等位基因是提高山羊产羔数的一个潜在有效的DNA标记。
关键词： 山羊 高繁殖力 类固醇21-羟化酶基因(CYP21) PCR-SSCP
