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资源类型: 中文期刊
关键词:表达分析(模糊匹配)
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驴FBXL3基因在发情期和乏情期各组织表达谱差异及氨基酸特征分析

黑龙江畜牧兽医 2024 北大核心

摘要:为了探究FBXL3基因在驴卵巢、卵泡液和乳腺的表达水平与驴发情期和乏情期之间的关系,试验以德州毛驴为研究对象,利用qPCR方法分析FBXL3基因在发情期和乏情期不同组织中的表达情况,利用生物信息学方法预测FBXL3蛋白质的理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、蛋白质相互作用情况、二级结构和三级结构。结果表明:FBXL3基因在发情期卵巢和卵泡液中的相对表达量极显著高于乏情期(P<0.01),乳腺中的相对表达量显著高于乏情期(P<0.05)。FBXL3蛋白有37个酶解位点,属于亲水性蛋白,无跨膜结构域,主要分布在线粒体上,为酸性、不稳定蛋白质;FBXL3蛋白中α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链分别占49.30%、2.57%、35.98%和12.15%,与三级结构预测结果一致;SKP1、FBXL13、CRY1、CRY2、PER1、PER2等蛋白与FBXL3蛋白存在相互作用。说明FBXL3基因在发情期和乏情期的表达具有组织特异性。

关键词: FBXL3基因 表达分析 生物信息学 季节性发情 组织表达谱

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斜带石斑鱼mstn对其肌肉细胞增殖分化及相关基因表达的影响

中山大学学报(自然科学版)(中英文) 2022 北大核心 CSCD

摘要:斜带石斑鱼Epinephelus coioides是具有较高经济价值的海水鱼,如何促进石斑鱼生产性状改良一直是科学研究的重点之一.肌肉生长抑制素(mstn,myostatin)是调节肌肉生长的重要转化因子.本研究中,Mstn的亚细胞定位表明Mstn在斜带石斑鱼细胞质中呈点状分布.利用酶标仪测定被Mstn重组蛋白刺激肌肉原代细胞1~5 d后的A值,发现实验组细胞生长明显减缓,随着处理时间的增加,细胞活性差异进一步扩大.利用流式细胞仪测定被Mstn重组蛋白刺激的肌肉原代细胞细胞周期,发现实验组细胞周期受阻.用Mstn重组蛋白对肌肉原代细胞进行刺激,通过RT-qPCR检测Mstn重组蛋白对mstn信号通路及下游相关基因的影响,结果表明随着处理浓度的升高,p21、smad3和mrf4 mRNA的表达量也逐渐而上升,其中,smad3和mrf4表达量的上升不存在显著性差异;当处理浓度为100和1000 nmol/L时,p21存在显著性差异;随着处理浓度的升高,myod和myog mRNA的表达量均下降,但myod mRNA下降趋势不显著,myog mRNA显著下降,当处理浓度为100和1000 nmol/L时存在显著性差异.本研究揭示了Mstn定位于斜带石斑鱼GS细胞质;Mstn重组蛋白上调smad3、mrf4的表达,下调myod、myog的表达,来促进细胞的分化;同时Mstn重组蛋白能上调p21的表达,抑制细胞的增殖.本研究验证了Mstn在肌肉发育过程中的生物学功能,为后续深入开展mstn对鱼类肌肉发育的影响研究奠定了基础.

关键词: mstn 斜带石斑鱼Epinephelus coioides 肌肉 表达分析

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