科研产出
基于F基因的鸽新城疫病毒分子特征分析
《现代畜牧兽医 》 2023
摘要：试验旨在了解鸽新城疫病毒流行株的分子特征,利用MEGA7.0、Lasergene7.0软件对2020-2022年新疆和田地区规模化养鸽场流行病学调查阳性样品进行了鸽新城疫病毒F基因的测序和序列分析.结果显示,6株F基因属于Ⅵ.2.1.1.2.2基因亚型,F蛋白裂解位点序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与基因Ⅱ型疫苗株La Sota株、HB1株、VG/GA株、Clone30株及基因Ⅲ型Mukteswarz株的核苷酸同源性为83.5%~85.7%,与甘肃、宁夏鸽新城疫核苷酸同源性为97.3%~99.5%.6株F蛋白融合肽区均有两处氨基酸突变(V121I、A132S),HRa区均有1处氨基酸突变(V179I),NDV/PIGEON/XJHT/802/2022/F在HRb、HRc和跨膜区还有1~2个氨基酸突变.研究表明,该地区鸽新城疫病毒遗传相对稳定,变异持续存在,定期监测与分析鸽新城疫病毒分子流行特征十分必要.
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小反刍兽疫核酸疫苗的制备及免疫效果评估
《黑龙江畜牧兽医 》 2021 北大核心
摘要：为了制备针对小反刍兽疫病毒（Peste des peties ruminants virus, PPRV）F基因的核酸疫苗,并评价其对小鼠的免疫效果,试验采用DNA重组技术将F基因、优化密码子后的F基因以及连接乙型脑炎病毒信号肽（JEVSP）的优化密码子后的F基因3个目的片段分别克隆到真核表达载体pcDNA3.1（+）,构建重组质粒pcDNA3.1（+）-F、pcDNA3.1（+）-F-opt和pcDNA3.1（+）-JEVSP-F-opt,大量培养重组质粒菌后,以碱裂解法将菌体悬浮裂解,经中空纤维切向流超滤和微滤浓缩处理,将制备的核酸疫苗以100μg/只的剂量给Balb/c小鼠肌肉注射免疫,共分为4组,pcDNA3.1（+）-F组、pcDNA3.1（+）-F-opt组、pcDNA3.1（+）-JEVSP-F-opt组和pcDNA3.1（+）空载体组,每隔14 d免疫1次,共免疫3次,每次免疫14 d后利用中和试验检测抗体水平。结果表明:成功制备核酸疫苗pcDNA3.1（+）-F、pcDNA3.1（+）-F-opt和pcDNA3.1（+）-JEVSP-F-opt,免疫Balb/c小鼠14 d后pcDNA3.1（+）空载体免疫组中和抗体阳性率为0,pcDNA3.1（+）-F组、pcDNA3.1（+）-F-opt组、pcDNA3.1（+）-JEVSP-F-opt组抗体转阳性,且pcDNA3.1（+）-F-opt组、pcDNA3.1（+）-JEVSP-F-opt组抗体水平呈逐渐增加的趋势。说明成功制备小反刍兽疫核酸疫苗,并且能在小鼠上产生抗体。
关键词： 小反刍兽疫 F基因 核酸疫苗 制备工艺 浓缩 免疫水平
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一株新疆野鸟源新城疫病毒的分离鉴定、F基因克隆及遗传进化分析
《中国畜牧兽医 》 2017 北大核心
摘要：为了解新疆野鸟新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)感染情况,分析其分子特征和基因变异特点,防止新城疫的暴发和蔓延,本试验用9日龄SPF鸡胚进行病毒的分离传代,HA、HI试验和RT-PCR方法对位于"东非—西亚迁徙线"福海县的野鸟进行了NDV检测,分离到1株野鸟源NDV,并命名为NDV/Pintail/CH(XJ)/01/2016。结果表明,该NDV分离株F基因ORF长1 662bp,编码553个氨基酸,F基因碱性裂解位点序列为~(112)G-R-Q-G-R-L~(117),符合弱毒株特征;遗传进化分析显示,NDV/Pintail/CH(XJ)/01/2016与乌克兰鸽源分离株Doneck/3/968、比利时鸭源分离株Simeonovgrad核苷酸同源性均为99.7%,属于NDV ClassⅡ基因Ⅱ型。而上述3株病毒均与疫苗毒La Sota具有较高同源性(99.5%~99.8%)。本研究结果为家禽NDV外流进入自然环境提供了论据。
关键词： 野鸟 新城疫病毒(NDV) F基因 遗传进化分析
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鸡新城疫病毒新疆分离株F基因遗传进化分析
《动物医学进展 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：对2株分离自新疆乌鲁木齐市的鸡源新城疫病毒F基因进行了扩增、序列测定和分析。结果显示,该2株新城疫病毒F基因核苷酸序列长度分别为1 586bp和1 654bp,分別编码520和545个氨基酸;氨基酸裂解位点的序列均为112R-R-Q-K-R-F117,具备了基因Ⅶ型强毒株的特征;同源性分析表明,该2株新城疫病毒分离株与现用疫苗毒株的同源性在81.8%～84.2%之间,与国内外流行的基因Ⅶ型新城疫病毒同源性在87.4%～98.2%之间,与基因Ⅶd亚型新城疫病毒株的同源性较高,为94.4%～98.2%;遗传进化分析表明,该2个毒株与FJ882014-LN、FJ608335-XJ、FJ80805-JL等国内流行的基因Ⅶd亚型新城疫病毒株在一个分支内亲缘关系最近。
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5株禽新城疫病毒新疆分离株F基因序列测定与遗传进化分析
《中国畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要：从新疆乌鲁木齐市郊区养禽场发病禽群中分离到4株鸡源新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)和1株鸽源NDV。经血凝HA试验鉴定,NDV分离株均具有血凝性,5个毒株的血凝特性均可被NDV阳性血清所抑制,而不能被禽流感病毒(H5亚型与H9亚型)阳性血清抑制。本试验通过RT-PCR扩增了5株NDV全长F基因并进行了序列测定。序列分析表明,5株NDV的核苷酸序列分别为1662、1589、1676、1589和1662bp,均含有1个开放阅读框,分別编码553、528、553、520和553个氨基酸;根据基因裂解位点的氨基酸序列分析表明,鸡源XJ/10/08株属于强毒株,XJ/3/07株、XJ/7/07株、XJ/9/08株和XJ/11/08株属于弱毒株;同源性分析表明,5个NDV新疆分离株与LaSota疫苗株的核苷酸同源性在83.7%～99.8%之间,与TaiWan95株核苷酸同源性在84.7%～93.3%之间;遗传发育进化树分析表明,分离到的4个弱毒株与La-Sota、Clone30、B1、BEA-45在同一亚群,属基因Ⅱ型,强毒分离株与TaiWan95、广东株(GD-1-98)、江苏株(JS-5-1)在同一进化分支内,属基因Ⅶ型。
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新城疫病毒分离株F基因的克隆与序列分析
《动物医学进展 》 2009 北大核心
摘要：应用RT-PCR分别扩增出新城疫病毒(NDV)青海株(QH3)、黑龙江株(HLJ)和甘肃株(A4)的融合蛋白(F)基因的全长核苷酸,再克隆到pMD18-T载体中。经酶切和质粒PCR鉴定,获得阳性重组质粒后,进行序列测定并推导出其氨基酸序列,同时进行分析和比较。序列分析结果表明,所获得的3个分离株F基因完整的开放阅读框长度为1662bp,共编码F蛋白的553个氨基酸;3个毒株之间的核苷酸序列同源性为88.0%～90.6%;与常用疫苗株之间核苷酸序列同源性只有85.3%～91.6%。三者F基因的裂解位点均为112R-R-Q-K/R-R-F117,符合强毒株裂解区氨基酸组成的特征。以1bp～374bp的核苷酸序列绘制系统发育树分析表明,QH3株NDV为基因Ⅷ型,A4株NDV为基因Ⅵ型,HLJ株NDV为基因Ⅸ型。
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