禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4(H5N1)的PB1、PB2和PA基因测序及进化分析

汪萍; 沙依兰古丽; 符子华; 盛卓君; 巴哥得力; 陆桂丽; 成进; 《山东农业大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD

摘要：通过RT-PCR技术对禽流感病毒新疆株A/Duck/X J/4(H5N1)的PB1、PB2和PA基因分别进行了扩增及克隆,测序结果表明该毒株的PB2、PB1和PA基因全长核苷酸序列分别为2341 bp、2282 bp和2187 bp。同源性分析表明A/Duck/X J/4(H5N1)株与禽源、野生鸟类和猪源的禽流感毒株均有很高的同源性(86.3%~99.6%)。与人源毒株相比,PB2和PA与A/HK/156/97(H5N1)株的同源性较低(86.3%~88.7%);与A/V ietnam/CL01/2004(H5N1)株和A/hum an/Zhejiang/16/2006(H5N1)株的同源性较高(93.0%~98.8%);PB1与人源毒株A/HK/156/97(H5N1)、A/V ietnam/CL01/2004(H5N1)、A/hum an/Zhejiang/16/2006(H5N1)同源性为91.1%~93.2%。

关键词： 禽流感病毒 PB1、PB2和PA基因 RT-PCR 序列分析