科研产出
5种miRNA在牛背最长肌中表达及其与肉质性状相关性研究
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为研究miRNA表达水平与牛肉质性状的相关性，本研究以新疆褐牛和哈萨克牛背最长肌组织为研究对象，采用荧光定量PCR技术检测了背最长肌组织中的miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a表达情况。结果显示：新疆褐牛背最长肌组织中miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451表达水平显著高于哈萨克牛，miR-125a表达水平显著低于哈萨克牛。相关性分析显示：miR-320a、miR-152、miR-143、miR-451、miR-125a与脂肪含量呈极显著正相关；miR-320a、miR-152与肉豆蔻酸含量呈显著正相关，miR-143与肉豆蔻酸含量呈极显著正相关，miR-152、miR-125a与棕榈烯酸呈显著负相关，miR-143与亚油酸呈显著负相关；miR-320a、miR-152、miR-143与失水率呈显著负相关；miR-320a、miR-143与黄度值、pH呈显著正相关；miR-320a与红度值呈显著正相关。结果表明：miR-320a、miR-152、miR-143、miR-125a表达量增加促进肌肉组织脂肪沉积，其中miR-152、miR-143、miR-125a通过改变脂肪酸组成从而增加脂肪含量；miR-320a、miR-152、miR-143表达量增加会显著降低背最长肌失水率，有助于提高肉出品率；miR-320a、miR-143表达量增加可使肉色变深，是影响肉色泽的重要遗传因素。
全文链接
请求原文
苏博美利奴羊毛囊发育不同时期ncRNA调控网络的构建
《中国畜牧杂志 》 2022 北大核心
摘要：为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络.结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接.通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能.通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径.筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因.通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博美利奴羊毛囊发育的分子作用机制进行系统性挖掘.
关键词： miRNA lncRNA mRNA 毛囊发育 调控网络 苏博美利奴羊
全文链接
请求原文
中国美利奴羊羊毛弯曲相关microRNA的筛选
《新疆农业科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究miRNA在不同羊毛弯曲中国美利奴羊皮肤组织中的表达差异及其可能参与的调控通路,筛选出与中国美利奴羊羊毛弯曲相关的miRNA,为进一步探究细毛羊羊毛弯曲性状的调控机理提供理论依据。【方法】运用高通量测序技术对羊毛弯曲频率有极端差异表型值（大弯曲组与小弯曲组）细毛羊个体皮肤的miRNA组进行测序与比较分析。【结果】共鉴定出425个miRNAs,其中包括143个已知miRNAs和282个新发现的miRNAs。在大弯曲组与小弯曲组共筛选到8个上调和17个下调的miRNAs。对差异miRNA的预测靶基因进行简单的Gene Ontology与KEGG Pathway富集分析。差异表达的miRNA的靶基因主要参与跨膜信号受体活动、信号转导活动、分子转导活动、膜的组成等过程。15 761个靶基因注释到252个信号通路。【结论】筛选出了25个与细毛羊羊毛弯曲性状相关的候选miRNAs。
全文链接
请求原文
不同绒细度的西藏绒山羊皮肤组织miRNA分析与鉴定
《农业生物技术学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：微小核糖核酸（microRNA, miRNA）作为重要的基因调控元件,在多种哺乳动物皮肤及毛囊中均有表达,并在转录后水平调节皮肤和毛发的生长和发育过程。本研究旨在对西藏绒山羊（Capra hircus）皮肤组织miRNA进行分析与鉴定,探讨miRNA在绒毛纤维直径性状中可能发挥的作用及调控机制。分别选取细绒（平均纤维直径（12.04±0.03）μm）和粗绒（平均纤维直径（14.88±0.05）μm）的西藏绒山羊各4只,对肩胛部皮肤组织提取RNA建立文库进行高通量测序。对原始序列进行过滤,并与参考基因组（ARS1）比对;根据miRBase中已知miRNA和参考基因组中其他非编码RNA （non coding RNA, ncRNA）的位置信息,对miRNA和其他小RNA进行鉴定,筛选出不同绒毛细度的西藏绒山羊皮肤组织差异表达miRNA,并进行靶基因预测及功能分析;进一步利用qPCR验证5个miRNAs与测序结果的一致性。结果表明,每个样本至少获得20.09 M条原始读长,过滤后至少得到19.46 M条有效读长（clean reads）,共鉴定出426个已知miRNAs和119个新miRNAs;筛选获得12个差异表达miRNAs,其中5个miRNAs在细绒型西藏绒山羊皮肤组织中显著上调表达,7个miRNAs显著下调表达;差异表达miRNAs共预测到621个靶基因,KEGG分析显示靶基因富集到B细胞受体信号通路、FcεRI信号通路、T细胞受体信号通路等生物学通路中;同时,选取的5个miRNAs的qPCR验证结果与测序分析的表达趋势一致。本研究结果提示,西藏绒山羊的绒细度可能受不同miRNAs调控,这些miRNAs进一步影响靶基因的表达并参与调控不同的信号通路。本研究为深入揭示调控山羊绒细度的miRNAs和相关信号通路提供参考依据。
全文链接
请求原文
激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：[目的]通过small RNA高通量测序技术,筛选绵羔羊和成年母羊差异表达miRNA,进一步挖掘和鉴定与卵泡发育相关的相关基因,揭示其性状差异的信号通路及分子调控网络.[方法]以绵羔羊和成年母羊颗粒细胞为研究对象,应用高通量测序技术进行small RNA文库构建,获得miRNA表达谱,鉴定差异表达miRNA,进而对这些差异表达miRNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集等.[结果]从2个样本miRNA库鉴定出238个已知miRNAs和79个新miRNAs.共获得9个差异miRNA,与成年羊相比,羔羊有4个miRNA上调,5个下调.其中,oar-miR-106a上调倍数最大(1. 85),oar-miR-10a下调最为显著(-2. 20).对差异miRNAs进行GO富集和KEGG通路富集分析表明,新陈代谢途径富集的基因最多.利用qRT-PCR对5个随机挑选的miRNA进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠.[结论]miRNAs可能在激素处理后对绵羊生殖生理中起着重要的作用,包括卵泡和卵母细胞的发育,颗粒细胞的增殖等.
全文链接
请求原文
激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】通过small RNA高通量测序技术,筛选绵羔羊和成年母羊差异表达miRNA,进一步挖掘和鉴定与卵泡发育相关的相关基因,揭示其性状差异的信号通路及分子调控网络。【方法】以绵羔羊和成年母羊颗粒细胞为研究对象,应用高通量测序技术进行small RNA文库构建,获得miRNA表达谱,鉴定差异表达miRNA,进而对这些差异表达miRNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集等。【结果】从2个样本miRNA库鉴定出238个已知miRNAs和79个新miRNAs。共获得9个差异miRNA,与成年羊相比,羔羊有4个miRNA上调,5个下调。其中,oar-miR-106a上调倍数最大(1. 85),oar-miR-10a下调最为显著(-2. 20)。对差异miRNAs进行GO富集和KEGG通路富集分析表明,新陈代谢途径富集的基因最多。利用qRT-PCR对5个随机挑选的miRNA进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠。【结论】miRNAs可能在激素处理后对绵羊生殖生理中起着重要的作用,包括卵泡和卵母细胞的发育,颗粒细胞的增殖等。
全文链接
请求原文
山羊microRNA研究进展
《动物学杂志 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：小RNA(micro RNA,mi RNA)是真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,长度约20~25个核苷酸。研究表明,mi RNA参与真核生物的许多生命过程,包括个体发育、新陈代谢、细胞生长和凋亡等方面。目前,关于山羊(Capra aegagrus hircus)的mi RNA数据相对较少。文章综述了山羊mi RNA对皮肤与毛囊发育、肌肉生长发育、泌乳及生殖的调控作用,为利用mi RNA调控和改善绒山羊毛绒品质、生长性能及繁殖性能等提供理论基础和研究思路。
全文链接
请求原文
利用Solexa测序技术鉴定策勒黑羊microRNA
《中国畜牧兽医 》 2016 北大核心
摘要：试验旨在挖掘、分析策勒黑羊卵巢组织microRNA(miRNA),为进一步研究特定miRNA参与策勒黑羊卵泡发育及激素分泌等相关生殖活动的机制奠定理论基础。从策勒黑羊卵巢组织中提取总RNA,分离、构建小片段RNA文库,进行Solexa测序和生物信息学分析。结果表明,共获得9 527 311条干净序列读数,小RNA序列长度主要分布在21~23nt;共鉴定出434个策勒黑羊卵巢组织表达的保守miRNA,其中表达量在100以上有167个;鉴定出57个候选miRNA,其中表达量在100以上有8个。测序成功获取了策勒黑羊卵巢组织miRNA序列及表达谱,卵巢组织miRNA表达丰富且表达量各异。
全文链接
请求原文
动物胚胎发育中的MicroRNAs研究进展
《草食家畜 》 2014
摘要：MicroRNA(miRNA)是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA,具有调控功能,长度约有20~25个核苷酸,它通过与靶基因特异性的碱基配对引起靶基因的降解或者抑制其翻译,从而实现对靶基因的转录后表达的调控。文章综述了miRNA的发现、体内生成机制、作用机制及不同动物种类胚胎发育过程中miRNA的鉴定和研究,并并阐述了miRNA研究中的问题及应用前景。
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
