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畜禽长链非编码RNA的功能及其研究方法

文献类型: 中文期刊

作者: 陆启荣 1 ; 刘孟轲 1 ; 李丽 1 ; 程古月 1 ; 郝海红 1 ; 王旭 1 ; 戴梦红 1 ; 袁宗辉 1 ;

作者机构: 1.华中农业大学动物医学院国家兽药残留基准实验室(HZAU)农业部畜禽产品质量安全风险评估实验室(武汉)农业部兽药残留检测重点开放实验室

关键词: 长链非编码RNA;畜禽;生物学功能;研究方法

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2016 年 09 期

页码: 2425-2434

收录情况: 北大核心

摘要: 长链非编码RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,不具有编码蛋白质的能力,主要参与脂肪代谢、肌肉发育、胚胎发育、性别决定与分化等多种生物过程和疾病的调控。在LncRNA研究中,研究方法的建立和应用起着至关重要的作用。作者简述了LncRNA的生物学特性和生物学功能,重点介绍了LncRNA的主要研究方法:基因芯片、RNA-seq、Northern blotting、荧光原位杂交(FISH)、实时荧光定量PCR、RNA结构平行分析(PARS)、快速预测RNA和蛋白质相互作用(CatRAPID)等,同时介绍了LncRNA与DNA、RNA及蛋白质的相互作用的方法:RNA-pulldown、RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)、光活性增强的核糖核苷交联和免疫共沉淀(PAR-CLIP)、RNA反义纯化(RAP)、RNA纯化的染色质分离(CHIRP)及RNA靶标的捕获杂交分析(CHART)、交联,连接以及混合测序(CLASH),为畜禽动物中LncRNA的研究提供借鉴。

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