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利用SLAF-seq简化基因组测序技术对驴基因组进行测序分析

文献类型: 中文期刊

作者: 肖海霞 1 ; 阿布来提·苏来曼 1 ; 托乎提·阿及德 1 ; 努尔尼萨·莫拉尼亚孜 1 ; 帕热哈提江·吾甫尔 1 ; 王琼 1 ; 张国庭 1 ; 谢立荣 1 ; 苏玲玲 1 ; 买买提·克玉木 2 ; 田可川 1 ; 刘武军 3 ;

作者机构: 1.新疆维吾尔自治区畜牧科学院畜牧研究所

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3.新疆农业大学

关键词: 疆岳驴;SLAF-seq;测序分析

期刊名称: 畜牧业环境

ISSN: 2096-6188

年卷期: 2021 年 021 期

页码: 27-28

摘要: 本文利用SLAF-seq简化基因组测序技术,通过选择驴基因组预测电子酶切组合方式,最终使用RsaI+EcoRV-HF?进行酶切,酶切效率为95.24%,将长度为364~394bp的测序序列定义为一个SLAF标签,预测了到234762个SLAF标签.通过生物信息学分析获得SLAF标签数为1,416,014个SLAF标签数(900,598个多态性SLAF标签),获得的群体SNP为4,887,196个,为与疆岳驴乳用性状做全基因组关联分析奠定了基础.

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