科研产出
基于转录组分析技术筛选骆驼产奶性状相关基因
《草食家畜 》 2025
摘要：【目的】产奶性状是骆驼重要的经济性状，但目前骆驼产奶性状的研究尚不充分，产奶相关遗传机制的研究也鲜有报道。基于此，本研究计划通过转录组分析技术，深入挖掘骆驼产奶性状相关基因，以期为高产骆驼品种的选育工作提供数据支持。【方法】统一采集泌乳阶段骆驼的产奶量数据，将骆驼分为高产和低产组，并采集骆驼的血液进行转录组测序。【结果】通过对转录组数据进行统计分析，共筛选1 893个差异表达基因（FDR<0.05）,1 094个（57.80%）基因显著上调，799个（42.20%）基因显著下调。基因本体（Gene Ontology, GO）功能分析表明，分别有398条富集到生物过程（Biological process,BP）,98条富集到细胞组分（Cellular Component, CC）,260条富集到分子功能（Molecular function,MF）。京都基因和基因组数据库（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路分析显示，主要富集到NOD样受体信号通路（NOD-like receptor signaling pathway）、TNF信号通路（Tumor Necrosis Factor signaling pathway）、T细胞通路（T lymphocyte signaling pathway）、溶酶体（Lysosome Cellular）、细胞衰老（Cellular senescence）、金黄色葡萄球菌感染（Staphylococcus aureus infection），以及细胞分化（Osteoclast differentiation）等相关信号通路。【结论】通过转录组数据对比分析及基因功能注释，共筛选MAPK13、CCL5、AKT3、CFD、MAN2A1、CAMK2D,6个与乳腺发育和泌乳调控相关的候选基因。这些发现为未来研究高产骆驼的分子机制提供理论基础，有助于深入理解乳腺发育和泌乳机制的复杂调控网络。后续研究将重点验证这些基因的调控机制，并基于此优化骆驼繁殖策略，以实现高产骆驼的选育目标。
全文链接
请求原文
全基因组选择信号筛选和田羊异质被毛相关候选基因
《新疆农业科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：【目的】被毛类型是绵羊重要的品种特征之一，但是其形成的分子基础目前仍不清楚。筛选出与和田羊异质被毛有关的基因和通路，为进一步解析和田羊异质被毛的分子调控机制提供理论依据。【方法】对异质被毛和田羊和同质被毛中国美利奴羊的基因组信息进行选择信号分析，研究筛选出与和田羊被毛类型相关的候选基因。选取健康和田羊和中国美利奴羊成年母羊各15只，颈静脉采血，提取基因组DNA进行基因组重测序，基于全基因SNPs进行选择信号检测分析。将Fst和θπRatio的top1%作为阈值，筛选出SNPs位点进行注释，并对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，确定与和田羊异质被毛性状相关的候选基因和生物学通路。【结果】Fst和θπRatio两种方法共鉴别出732个受选择基因，这些基因被显著富集到多个与羊毛性状有关的KEGG通路和1条与毛囊发育有关的生物学过程通路。【结论】筛选出多个羊毛性状有关的通路和5个(BMPR2、LPAR6、RARA、CDC6和BNC1)可能与和田羊异质被毛相关的关键候选基因。
全文链接
请求原文
中国美利奴羊毛密度相关基因的筛选
《新疆农业科学 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析中国美利奴羊毛密度表型差异,筛选影响中国美利奴羊毛密度性状相关的候选基因,为阐明中国美利奴羊毛密度的分子调控机制提供参考.[方法]采用毛丛法对中国美利奴羊的羊毛密度和毛囊密度进行测定、统计分析,选择不同羊毛密度中国美利奴羊皮肤进行转录组测序,鉴定与羊毛密度性状相关的候选基因.[结果]中国美利奴高羊毛密度组(HWD组)的平均羊毛密度(9 852.02±1 673.98)根/cm2,极显著高于低羊毛密度组(LWD组)(5 390.61±1 365.67)根/cm2(P<0.01).HWD组与LWD组平均初级毛囊密度差异不显著,HWD组的平均次级毛囊密度、初级毛囊密度与次级毛囊密度比值、平均总毛囊密度均极显著高于LWD组(P<0.01).利用羊毛密度显著差异的中国美利奴羊皮肤转录组数据,HWD组相对于LWD组,共筛选出521 个差异表达基因,其中280 个基因表达上调、241 个基因表达下调.通过高、低密度组间差异基因富集、差异基因互作和差异基因表达验证等分析,筛选出KRT18、KRT16、LOC101116157、CCN3、SPARC、C7、ATP12A、ANGPT4、WNT16、S100A1 及S100A4 等,影响了中国美利奴羊毛生长及密度的差异表达基因.[结论]不同羊毛密度的细毛羊皮肤组织的基因表达谱存在差异,这些基因表达可通过改变皮肤毛囊及羊毛生长等过程影响羊毛密度.
全文链接
请求原文
特克赛尔羊*阿勒泰羊F2绵羊肉质嫩度全基因组关联分析
《家畜生态学报 》 2024 北大核心
摘要：为了定位影响绵羊嫩度相关SNP位点及其重要候选基因，该研究选取462只特克赛尔羊×阿勒泰羊F2绵羊，其中公羔229只、母羔233只，所有试验羊均在统一条件下饲养至8月龄后进行屠宰，利用C-LM4嫩度仪对嫩度进行测定，利用Illumina绵羊高密度（600K）SNP芯片进行基因分型，使用GEMMA软件的MLM模型对嫩度性状进行全基因组关联分析。结果表明，经质控后，剩余613 178个SNPs位点用于全基因组关联分析，发现9个潜在SNPs位点与嫩度相关，分别分布在2、6、23、24号染色体上。根据基因生物学功能及相关研究文献，推测EREG、AREG、PDE1A基因参与肌肉再生、肌纤维形成等生物学过程，可作为影响嫩度的重要候选基因。研究结果可为利用分子生物学方法改良绵羊肌肉嫩度提供科学依据。
关键词： 嫩度 特克赛尔羊×阿勒泰羊 F2 候选基因 全基因组关联分析 SNP
全文链接
请求原文
基于血液转录组探究皮山红羊繁殖性状候选基因的差异表达
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：皮山红羊作为新发现的优良地方品种，以多胎而闻名，本研究基于血液转录组测序技术对不同产羔类型皮山红羊差异表达基因（Differential Expression Genes,DEGs）进行筛选，同时探究皮山红羊在不同时期基因的表达差异。从具有连续两胎产羔记录的母羊群体中，随机选取20只体况一致的皮山红羊，分为高繁殖力组（H，胎产羔数≥2）和低繁殖力组（L，产单胎）。通过同期发情技术，采集埋栓前（T1,0 d）、黄体期（T2,10 d）和卵泡期（T3，撤栓后48 h）3个时期共60个血液样本，筛选不同产羔类型皮山红羊在不同时期的DEGs，利用实时荧光定量PCR对筛选出的DEGs进行验证。对60个血液样本进行转录组测序获得34 881 676～61 334 354 bp数据，有效过滤率94.72%～97.33%,Q20≥97.42%，比对率在93.21%～95.11%。在T1LvsT1H、T2LvsT2H及T3LvsT3H组分别有301、228、294个DEGs。其中，CCL14、PTGIS、PRLH等11个基因为不同产羔类型的共有DEGs。KEGG富集分析发现，ECM-受体相互作用、黏着斑、PPAR信号通路、细胞粘附分子等6条通路与繁殖性状相关，包含31个DEGs。结合蛋白互作网络分析，筛选到与皮山红羊繁殖过程相关的潜在基因COL3A1、COL1A1、ERBB2等。RT-qPCR结果表明，RNA-Seq结果准确可靠。本研究揭示了不同产羔类型皮山红羊血液中的DEGs，筛选到影响皮山红羊胚胎发育的ECM-受体相互作用、黏着斑、细胞粘附分子等重要通路，筛选出CCL14、PRLH、PTGIS、COL3A1、COL1A1、ERBB2等关键候选基因，以期为皮山红羊选种选育提供理论依据。
全文链接
请求原文
吐鲁番黑羊MC1R基因序列分析研究
《中国草食动物科学 》 2014
摘要：为研究黑皮质素受体1(MC1R)基因对吐鲁番黑山羊毛色的影响,试验采用PCR扩增和测序技术,对吐鲁番黑羊MC1R基因编码区核苷酸序列及其与毛色的相关性进行了研究。结果表明:MC1R基因编码区核苷酸序列954 bp,编码317个氨基酸,编码区存在2个错义突变(c.218 T>A,p.73 Met>Lys;c.361 G>A,p.121 Asp>Asn)和3个同义突变(c.429 C>T,p.143 Tyr>Tyr;c.600 T>G,p.200 Leu>Leu;c.735 C>T,p.245 Ile>Ile)。SNPs分析表明,单倍型AATGT数量占62%。初步认为MC1R基因可以作为吐鲁番黑羊黑色被毛调控的候选基因。
全文链接
请求原文
添加不同因子对绵羊类胚胎干细胞多能性的影响
《中国草食动物科学 》 2012
摘要：为筛选出更有利于维持绵羊类胚胎干细胞(oESC-like cell)多能性的因子,在基础培养基N2B27/CH中,分别添加PD、PD+hLIF、PD+BPM4、PD+hLIF+BMP4,通过比较分析,初步筛选出了比本实验室原培养体系(N2B27/CH+bFGF)更利于维持oESC-like多能性的培养基添加因子。结果显示:基础培养基中添加PD、PD+hLIF后细胞生长较好,细胞之间的结合更加致密;各种培养基培养物都表达AKP与Sox2、Oct4免疫荧光蛋白等oESC-like多能性标志;4种不同培养基与bFGF相比,细胞的生长速度减慢;在基础培养基N2B27/CH中添加PD和PD+hLIF使多能性候选基因Lin28与c-Myc表达量极显著升高(P<0.01),Nestin的表达量极显著下调(P<0.01),加入PD+hLIF使Oct4表达量极显著上调(P<0.01)。因此,在oESC-like基础培养液N2B27/CH的基础上,添加PD或PD+hLIF更有利于oESC-like细胞多能性维持。
关键词： 绵羊类胚胎干细胞 体外培养 多能性调控因子 候选基因
全文链接
请求原文
羊毛细度候选基因的研究进展
《生命科学仪器 》 2007
摘要：随着分子生物学的快速发展,各种分子标记技术在许多领域得到了广泛的应用。羊毛细度一直以来是制约我国羊毛产品的主要因素,本文论述了用KAP和KRT基因作为羊毛细度候选基因的理论依据,并阐述通过PCR-SSCP分子标记的方法对羊毛细度进行分析的可能性。
全文链接
请求原文
优质细毛羊羊毛细度的候选基因分析
《遗传 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR-SSCP的分子标记技术,选择编码羊毛纤维组成蛋白基因中的KAP1.1、KAP1.3的部分序列、KAP6.1的外显子区作为候选基因,通过对其多态性的研究,探索将该基因作为候选基因来间接选择羊毛细度性状的可行性。得出其中在角蛋白辅助蛋白的多基因家族中的高硫蛋白辅助蛋白基因(KAP1.1、KAP1.3)中,位点W08667与羊毛细度有显著的相关性(P<0.05)。在甘氨酸酪氨酸角蛋白辅助蛋白中,外显子位点W06933的AA基因型和BB基因型与羊毛细度之间有显著的相关性(P<0.05)。
全文链接
请求原文
首页上一页1下一页尾页
