科研产出
湖羊CEL基因多态性及其与眼肌面积性状的关联分析
《华北农学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：旨在探讨羧基酯脂肪酶基因(CEL)的单核苷酸多态性与湖羊眼肌面积的相关性。选取1 049只具有准确表型记录且健康的湖羊，屠宰后测定其眼肌面积，采集血液提取基因组DNA,通过PCR和KASPar SNP分型技术对CEL基因进行目的片段扩增和基因分型，并与湖羊眼肌面积进行关联分析，采用RT-qPCR检测CEL基因在湖羊10种组织中的表达情况。结果显示，湖羊CEL基因在不同组织中均有表达，且在十二指肠中表达量最高；该基因存在一个g.4039718 C>T的同义突变，呈中等多态。性状关联分析表明，该多态位点与湖羊的眼肌面积显著关联，TT型个体的眼肌面积显著高于CC型个体。描述性统计结果显示，眼肌面积的变异系数为12.29%,具有较高的选择潜力。相关性分析表明，眼肌面积与体质量、体高、体长、胸围、屠宰率、胴体质量和宰前活质量等生长性状和屠宰性状呈正相关。结果表明，g.4039718 C>T多态位点可作为候选分子标记用于湖羊眼肌面积性状的遗传改良。
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ZBTB4基因多态性与驴体尺性状的关联分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究在课题组前期关于驴体尺性状全基因组关联分析的基础上，探索候选基因ZBTB4在不同驴群体中的遗传多态性，并与体尺性状进行关联分析，寻找与驴体型大小显著相关的分子遗传标记，为驴的专门化品种培育提供参考。试验共挑选阳原驴、广灵驴和新疆驴3个中国地方驴品种以及1个未鉴定的小体型驴品种，总计340头成年母驴作为研究对象，通过PCR扩增ZBTB4基因外显子及周围部分序列，通过测序结果寻找单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）位点，并将SNP位点的基因型与驴体尺性状进行关联分析。结果表明：在ZBTB4基因第2内含子（rs1:14342082A>G）和第4外显子（rs2:14345176A>G）上共发现了2个SNP位点。通过对SNP位点与试验驴体尺性状关联分析发现，2个SNP位点的基因型与驴体型大小显著相关，即不同基因型在体高、体长、胸围、管围4种性状上存在显著差异。其中，AA基因型个体的体尺数据显著高于GA和GG基因型，GA基因型个体显著高于GG。综上，ZBTB4基因的2个SNP位点（rs1:14342082A>G,rs2:14345176A>G）可作为驴体尺性状的分子遗传标记，为驴的分子育种和品种选育提供理论支持。
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PTPN11基因多态性及与细毛羊重要经济性状的关联分析
《新疆农业大学学报 》 2018
摘要：为分析中国美利奴羊(新疆型)PTPN11基因的多态性及与细毛羊重要经济性状的相关性,寻找可用于中国美利奴羊(新疆型)选育的分子遗传标记。本研究运用PCR-SSCP技术检测PTPN11基因的多态性,用SAS 8.1软件中的最小二乘方法分析PTPN11基因与羊毛性状的关联性。结果表明,PTPN11基因共检测到了AA、AB和BB 3种基因型,其基因型频率分别为0.28、0.52和0.20;A、B等位基因频率分别为0.54和0.46,A等位基因占优势。χ~2检验显示,PTPN11基因处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),PTPN11基因位点的多态信息含量为0.37,PTPN11基因在该群体中处于中等程度的遗传变异。不同基因型的个体对弯曲评分有显著影响(P<0.05),对其他性状均无显著影响(P>0.05)。
关键词： PTPN11基因 PCR-SSCP 细毛羊 关联分析
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基于DNA池重测序技术研究细毛羊LAMB1基因的SNPs分析
《农业生物技术学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：层粘连蛋白β1(laminin-beta-1,LAMB1)作为层粘连蛋白家族成员之一,在生物过程中发挥极为重要的作用。为了分析细毛羊(Ovis aries)毛性状相关候选基因LAMB1的遗传效应,本研究通过DNA池重测序技术筛选了LAMB1基因外显子区的5个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),对其使用聚合酶链反应-单链构象多态性(single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products,PCR-SSCP)技术分型,在此基础上,利用SAS 8.1的GLM程序分析其对新疆巩乃斯种羊场418只细毛羊毛性状的遗传效应,利用Haplo View 4.2软件进行连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析。结果显示,该细毛羊群体遗传变异处于中等水平,LAMB1的5个SNPs发生错义突变。SNP2中AA和GA基因型个体鉴定时体重、剪毛后体重极显著高于GG基因型个体(P<0.01);SNP4中CC、TT和TC基因型个体间的自然长度差异极显著(P<0.01),CC基因型个体的剪毛后体重极显著高于TT和TC基因型的个体(P<0.01);而其他SNPs各基因型个体间的部分毛性状有显著差异(P<0.05)。SNP1和SNP3、SNP2和SNP3处于连锁不平衡状态,LAMB1基因可作为具有潜在应用价值的细毛羊毛性状分子标记之一。本研究揭示了LAMB1基因的分子遗传特征及其与细毛羊群体的遗传关系,为高效选育细毛羊经济性状及对其种质资源的保护与利用提供了分子学基础。
关键词： DNA池重测序 层粘连蛋白β1基因(LAMB1) 细毛羊 遗传效应 关联分析
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细毛羊KRT26基因多态性及其与羊毛细度的关联性分析
《中国畜牧兽医 》 2015 北大核心
摘要：本研究旨在揭示影响绵羊重要经济性状的功能基因的分子遗传特征及其与细毛羊群体的遗传关系,为高效选育绵羊品种经济性状及其种质资源的保护与利用提供分子遗传学依据。试验利用PCR-SSCP、DNA测序和生物信息学对289个细毛羊的KRT26基因进行遗传变异分析及其与细毛羊羊毛细度的关联性分析。结果表明,KRT26基因在该细毛羊群体中存在AA、AB、BB 3种基因型,其基因型频率分别为0.221、0.426和0.353,A、B等位基因频率分别为0.434、0.566,细毛羊群体的多态信息含量为0.371,呈中度多态水平,且处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P<0.05)。经过BioEdit软件比对序列和Chromas软件分析测序结果显示,KRT26基因发现5处碱基突变:83bp(G/C)、86bp(T/C)、112bp(C/T)、140bp(G/A)和247bp(C/T),并通过氨基酸序列的比对结果表明,2处发生了氨基酸的替代,即Val/Ile和Asn/Lys。KRT26基因在细毛羊群体中AA基因型个体极显著高于AB和BB基因型(P<0.01)。因此,KRT26基因可能作为羊毛细度性状的一个新的分子标记。
关键词： KRT26基因 细毛羊 遗传多态性 羊毛细度 关联分析
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