科研产出
新疆地区牛冠状病毒的分子流行病学调查
《畜牧兽医学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：牛冠状病毒（bovine coronavirus, BCoV）是造成犊牛腹泻的主要病原之一。新疆养牛业发展迅速，国内外引入品种数量日益增多，BCoV感染呈上升态势，但对其流行现状与规律缺乏全面了解。本研究于2020—2022年对新疆南、北疆养牛业主产区BCoV感染的流行情况进行了两年跟踪调查，共采集犊牛腹泻粪样本652份，采用RT-PCR方法进行了BCoV检测。对分离鉴定到的毒株进行了遗传进化分析。结果发现，BCoV总阳性率23.93%（156/652）。BCoV感染呈季节性变化，冬季为主要感染季节，检出率高达50.85%。南疆地区BCoV发病率高于北疆地区。与奶用犊牛相比，肉用犊牛更易感染。遗传进化分析表明：本试验分离到的BCoV毒株暂命名为BCoV/China/XJ-CJ/2022,该毒株的S基因与2018年毒株MN982199.1进化关系最近，N基因与2018年毒株MK095169.1BCOV-China/SWUN/LN4/2018进化关系最近，M基因与2017年毒株MK095148.1 China/SWUN/SC1/2017进化关系最近，HE基因与2017年毒株MK095136.1 BCOV-China/SWUN/SC2/2017进化关系最近。使用软件分析BCoV/China/XJ-CJ/2022与其它国家出现的BCoV毒株之间未出现基因重组现象。经5个结构蛋白的核苷酸和氨基酸相似性分析，发现其基因依然与中国国内本土毒株FJ938064.1＿E-AH187-TC相似度最高，分别最低达到91.50%和96.70%。调查结果表明，BCoV在新疆规模化牛场呈现出的季节、地域和品种间的感染差异性可为精准防控策略的制定提供数据支撑。
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牛冠状病毒与大肠埃希氏杆菌混合感染的实验室诊断
《草食家畜 》 2022
摘要：为查明新疆喀什地区某牛场发生犊牛腹泻的原因，采集了8头病死犊牛及2头健康犊牛的粪便进行病原学诊断。对采集到的粪便采用细菌分离培养鉴定、药物敏感性试验，并对引起犊牛腹泻的常见病毒开展RT-PCR检测。结果显示分离出的致病菌为革兰氏阴性杆菌，经过16SrDNA测序表明该菌为致病性大肠埃希氏杆菌，其阳性率100%。药物敏感性试验显示，该致病菌对美罗培南、阿米卡星、阿奇霉素3种抗生素敏感，对其它10种抗生素耐药。牛冠状病毒（Bovine coronavirus,BCoV）RT-PCR检测阳性率为75%，牛病毒性腹泻/粘膜病（Bovine viral diarrhea/mucosal disease,BVD/MD）、牛轮状病毒（Bovine Rotaviruses,BRV）均为阴性。结论为该牛场犊牛腹泻主要由牛冠状病毒和致病性大肠埃希氏杆菌混合感染引起。
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