科研产出
鸡毒支原体对大环内酯类抗生素的耐药判定标准研究现状
《中国兽医学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：鸡的慢性呼吸道疾病是鸡常发的一种传染病,对家禽养殖业有非常大的危害,其致病菌主要是鸡毒支原体。大环内酯类抗生素是治疗鸡毒支原体病的常用药物之一,但由于不规范用药的问题,致使鸡毒支原体对大环内酯类抗生素产生了一定的耐药性,而且呈现越来越严重的趋势。为了指导临床合理用药,进而有效控制耐药性问题,制定耐药判定标准是必要条件。现综述了鸡毒支原体对大环内酯类抗生素耐药判定标准的研究现状,根据美国和欧盟耐药判定标准制定程序,为我国制定鸡毒支原体对大环内酯类抗生素的耐药判定标准奠定基础。
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基于R语言的四个品种肉羊体尺与体重相关性分析
《家畜生态学报 》 2018 北大核心
摘要：为研究不同品种肉羊体尺指标与体重之间的相关性,更好地为选种和选育工作服务,利用R语言对新疆天山畜牧生物工程股份有限公司4个品种肉羊的体重与其体尺指标进行相关性分析,逐步回归分析,并建立公母羊的最优回归模型。结果表明:杜泊羊、萨福克羊、陶赛特羊各体尺与体重间均存在显著或极显著相关关系(P<0.05),而特克赛尔公羊的尻长和腰角宽与体重间不存在显著相关关系(P>0.05),特克赛尔母羊的体长和管围与体重之间不存在显著相关关系(P>0.05);不同品种、不同性别肉羊的回归模型中所入选的体尺指标各不相同,但多数都包含胸围这一指标。在对肉羊选育时应以胸围为主同时参照相应回归模型,以获得更好效果。
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绵羊TGFβ2基因及其剪切体的克隆与生物信息学分析
《西北农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：旨在克隆绵羊TGFβ2(Transforming growth factor-β2)基因CDS,解析其序列及编码蛋白的生物学特性,为绵羊生产利用提供理论基础。采用PCR技术克隆获得TGFβ2基因的CDS,并进行生物信息学分析。结果表明:绵羊TGFβ2基因的CDS长度为1 329bp,编码442个氨基酸;其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2由于CDS部分缺失分别编码331和414个氨基酸。绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2编码蛋白的理论等电点分别为8.74、7.60和8.82,均存在1个信号肽和1个跨膜结构域,由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成;序列同源性分析发现,绵羊TGFβ2基因编码区的核苷酸和氨基酸序列与其他哺乳动物同源性较高,进化树分析表明,绵羊TGFβ2氨基酸序列与人类的进化关系较近,与斑马鱼较远;细胞定位分析表明TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2主要在细胞外基质中发挥作用,调控下游靶基因的表达。获得绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2完整的CDS,与TGFβ2转录本相比,TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2分别缺失111和28个氨基酸序列,其可能通过与TGFβ2转录本不同的分子调控机制发挥重要的生物学作用。
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发情期湖羊卵巢组织差异表达基因的筛选与分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2018 北大核心
摘要：为了筛选与湖羊发情相关的候选功能基因,试验以发情期湖羊卵巢组织cDNA为试验组,乏情期的湖羊卵巢组织cDNA为对照组,采用抑制性消减杂交(SSH)技术构建湖羊卵巢组织消减cDNA文库,并对筛选获得的功能基因进行生物信息学分析。结果表明:应用SSH技术成功构建了湖羊发情期卵巢组织消减cDNA文库;共挑取89个克隆进行测序分析,获得27个已知物种的同源基因序列和3个Novel序列;随机挑取16个阳性克隆进行PCR扩增,插入片段主要分布在150~750 bp之间;对27个已知同源基因进行功能分类,其中酶功能相关基因5个、核糖核酸结合功能相关基因10个、载体运输功能相关基因2个、调节功能相关基因3个、转运功能相关基因3个、未分类基因4个。说明试验成功筛选获得湖羊发情相关候选功能基因。
关键词： 湖羊 卵巢组织 发情期 乏情期 抑制性消减杂交 生物信息学分析
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激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：[目的]通过small RNA高通量测序技术,筛选绵羔羊和成年母羊差异表达miRNA,进一步挖掘和鉴定与卵泡发育相关的相关基因,揭示其性状差异的信号通路及分子调控网络.[方法]以绵羔羊和成年母羊颗粒细胞为研究对象,应用高通量测序技术进行small RNA文库构建,获得miRNA表达谱,鉴定差异表达miRNA,进而对这些差异表达miRNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集等.[结果]从2个样本miRNA库鉴定出238个已知miRNAs和79个新miRNAs.共获得9个差异miRNA,与成年羊相比,羔羊有4个miRNA上调,5个下调.其中,oar-miR-106a上调倍数最大(1. 85),oar-miR-10a下调最为显著(-2. 20).对差异miRNAs进行GO富集和KEGG通路富集分析表明,新陈代谢途径富集的基因最多.利用qRT-PCR对5个随机挑选的miRNA进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠.[结论]miRNAs可能在激素处理后对绵羊生殖生理中起着重要的作用,包括卵泡和卵母细胞的发育,颗粒细胞的增殖等.
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激素处理后绵羔羊和成年母羊卵巢颗粒细胞miRNA特征分析
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】通过small RNA高通量测序技术,筛选绵羔羊和成年母羊差异表达miRNA,进一步挖掘和鉴定与卵泡发育相关的相关基因,揭示其性状差异的信号通路及分子调控网络。【方法】以绵羔羊和成年母羊颗粒细胞为研究对象,应用高通量测序技术进行small RNA文库构建,获得miRNA表达谱,鉴定差异表达miRNA,进而对这些差异表达miRNA及其靶基因进行功能注释、聚类分析及通路富集等。【结果】从2个样本miRNA库鉴定出238个已知miRNAs和79个新miRNAs。共获得9个差异miRNA,与成年羊相比,羔羊有4个miRNA上调,5个下调。其中,oar-miR-106a上调倍数最大(1. 85),oar-miR-10a下调最为显著(-2. 20)。对差异miRNAs进行GO富集和KEGG通路富集分析表明,新陈代谢途径富集的基因最多。利用qRT-PCR对5个随机挑选的miRNA进行验证,结果与测序数据一致,说明测序结果可靠。【结论】miRNAs可能在激素处理后对绵羊生殖生理中起着重要的作用,包括卵泡和卵母细胞的发育,颗粒细胞的增殖等。
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绵羊凝血酶敏感因子1(TSP-1)基因的克隆及在不同生长时期卵泡中的表达
《江西农业大学学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：凝血酶敏感因子1(TSP-1)基因在模式动物中发挥着各种生物学功能,FSH诱导后羔羊TSP-1的表达显著下调,而成年羊在激素诱导前后则无显著变化。为探究TSP-1基因的序列结构及生物学功能,实验采用PCR扩增的方法获得阿勒泰羊TSP-1基因的CDS区全长,软件分析TSP-1基因的蛋白质序列及其功能区域,同时利用荧光定量PCR的方法检测5头1周岁阿勒泰羊10个组织中的表达情况。结果显示,TSP-1基因序列全长为3 519 bp,共编码1 172个氨基酸,与预测序列相比有2个无义突变。系统进化树分析表明绵羊与牛、野猪的遗传距离较近。TSP-1蛋白结构不稳定,不存在跨膜结构,有一个信号肽,可能存在6个N-糖基化位点、50个潜在O-糖基化位点以及44个潜在的磷酸化位点,与TSP-3蛋白含有2个长重复区、3个短重复区、6个C型Ga离子结合位点和一个N型Ga离子结合位点。TSP-1基因在阿勒泰羊7个组织中都有表达,随着卵泡直径的增大,TSP-1基因的表达也逐渐升高。试验结果推测TSP-1基因可能在绵羊卵泡发育中发挥重要作用。
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添加不同比例甘草茎叶颗粒饲料对巴什拜羊生长性能、血液及免疫指标的影响
《石河子大学学报(自然科学版) 》 2018 北大核心
摘要：目的为了研究添加不同比例的甘草茎叶(Licorice stem and leaves,LSL)替代粗饲料制成全混颗粒饲料对巴什拜羔羊生长性能、血液生化指标及免疫指标的影响。方法本试验采用单因子设计,选择3-4月龄、体重相近(22.64±2.34) kg、健康状况良好的巴什拜羔羊36只,按完全随机区组设计分为4组,每组3个重复,每个重复3只,分别是对照组、25%甘草添加组、50%甘草添加组、75%甘草添加组。4组日粮水平基本一致,试验预饲期15 d,正试期60 d。结果各处理试验组与对照组相比增重、日增重及饲料转化率均有所提高,试验组间差异均不显著(P>0.05),25%LSL组增重效果和平均日增重以及饲料转化率高于50%LSL组及75%LSL组。各处理试验组之间血液甘油三酯含量和总胆固醇含量差异显著(P<0.05),钙含量各处理试验组间差异显著(P<0.05),25%LSL组甘油三酯和胆固醇含量低于对照组和50%LSL组及75%LSL组,总蛋白、白蛋白、钙和磷的含量均高于对照组和50%LSL组及75%LSL组。免疫球蛋白Ig A、Ig G、Ig M含量各处理试验组差异不显著(P>0.05),25%LSL组免疫球蛋白含量高于对照组和50%LSL组及75%LSL组。结论甘草茎叶适宜比例替代日粮中粗饲料有提高动物生产性能,改善血液性状及增强免疫的趋势,25%的替代比例饲喂效果较好。
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绵羊血小板糖蛋白4基因(CD36)的克隆及在不同生长时期卵泡中的表达
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】血小板糖蛋白4基因(CD36)在模式动物中发挥着各种生物学功能,通过转录组数据分析,可能在绵羊卵泡发育中发挥重要作用。本研究获得了CD36基因及探究其在不同组织中表达情况,从而预测其在绵羊生长过程中可能发挥的生物学功能。【方法】实验采用PCR扩增方法获得阿勒泰羊TSP-1基因的CDS区全长,运用软件分析CD36基因的蛋白质序列及其功能区域,同时利用荧光定量PCR的方法检测5头1周岁阿勒泰羊7个组织及不同直径卵泡中的表达情况。【结果】CD36基因序列全长为1419 bp,共编码472个氨基酸,与预测序列相比完全一致。系统进化树分析表明绵羊与牛的遗传距离较近。CD36蛋白为脂溶性亲水蛋白,具有1个跨膜螺旋结构,在氨基酸1~20位存在以信号肽,存在8个N-糖基化和41个潜在的磷酸化位点,包括19个Ser,15个Thr和7个Tyr。检测不同组织和不同直径卵泡中CD36基因发现:CD36基因在绵羊7个组织中都有表达,心与肺和小卵泡中CD36表达量差异显著(P<0.05),在不同直径卵泡中总体表达量较低。【结论】CD36基因可能在绵羊卵泡发育中发挥重要作用。
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