科研产出
和田羊体尺体重相关及主成分分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了探究成年和田羊体尺体重的关联性，本研究测定了和田市某羊场与和田市策勒县某羊场的758只成年和田羊体重和体尺，通过SAS 8.0和SPSS 19.0软件进行最小二乘分析、相关性和主成分分析，并建立和田羊生长性状主成分评估模型。结果表明：场效应对管围具有显著影响，对体重和其他体尺性状均有极显著影响；年龄效应对管围影响不显著，对体重和其他体尺性状影响极显著；性别效应对胸围和胸宽影响不显著，对体重和其他体尺性状有极显著影响；成年和田羊体重与各体尺性状之间均呈极显著正相关，各体尺性状之间存在显著或极显著的正相关关系。成年公羊选取前3个主成分，F1为体型因子，F2为肢体因子，F3为宽度因子；成年母羊选取前4个主成分，F1为体型因子，F2为重量因子，F3为肢体因子，F4为围度因子。根据选择的主成分建立的成年公羊生长性状主成分评估模型为：Y_公=0.306X1+0.286X2+0.304X3+0.264X4+0.249X5+0.391X6，成年母羊生长性状主成分评估模型为：Y_母=0.273X1+0.107X2+0.299X3+0.126X4+0.140X5+0.375X6。以上研究结果进一步揭示了体尺与体重的内在联系，为今后和田羊的饲养管理、选种选配提供理论依据。
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不同世代肉用褐牛生长性能与屠宰性能比较及部位肉品质差异研究
《中国畜牧兽医 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究3个世代肉用褐牛生长性能和屠宰性能的差异,并进行外脊、小黄瓜条和辣椒条部位的肉品质差异分析,为肉用褐牛品质育种提供数据参考.[方法]对育肥200 d后达到24(24m)、30(30m)月龄的第一(G1)、二(G2)、三(G3)世代共计313头肉用褐牛公牛进行体尺测定.随机从G1-24m(n=101)、G2-24m(n=75)、G3-24m(n=20)、G1-30m(n=53)、G2-30m(n=44)、G3-30m(n=20)组各选取8头牛进行屠宰性能测定,并对肉用褐牛外脊、小黄瓜条、辣椒条3个部位肉进行理化性质、营养成分及质构参数分析.[结果]G3-30m组公牛胸宽、髋宽、坐骨端宽、胴体重、净肉重、骨重均显著高于G1-30m和G2-30m组(P<0.05).与《新疆褐牛肉用新类型评定标准》(DB65/T 3791-2015)相比,除G1-24m组公牛体高、腰角宽相对增长率为-0.53%和-0.64%,以及G2-24m组公牛腰角宽相对增长率为-1.18%之外,其余指标均超出《新疆褐牛肉用新类型评定标准》中指标要求.在肉品质方面,外脊嫩度优于小黄瓜条和辣椒条,但保水性较差;3个部位肉适口性无显著差异(P>0.05).[结论]经过改良和选育,肉用褐牛的体格增大、胸围增长、体躯紧凑、肉用性能提高.
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ZBTB4基因多态性与驴体尺性状的关联分析
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：本研究在课题组前期关于驴体尺性状全基因组关联分析的基础上，探索候选基因ZBTB4在不同驴群体中的遗传多态性，并与体尺性状进行关联分析，寻找与驴体型大小显著相关的分子遗传标记，为驴的专门化品种培育提供参考。试验共挑选阳原驴、广灵驴和新疆驴3个中国地方驴品种以及1个未鉴定的小体型驴品种，总计340头成年母驴作为研究对象，通过PCR扩增ZBTB4基因外显子及周围部分序列，通过测序结果寻找单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）位点，并将SNP位点的基因型与驴体尺性状进行关联分析。结果表明：在ZBTB4基因第2内含子（rs1:14342082A>G）和第4外显子（rs2:14345176A>G）上共发现了2个SNP位点。通过对SNP位点与试验驴体尺性状关联分析发现，2个SNP位点的基因型与驴体型大小显著相关，即不同基因型在体高、体长、胸围、管围4种性状上存在显著差异。其中，AA基因型个体的体尺数据显著高于GA和GG基因型，GA基因型个体显著高于GG。综上，ZBTB4基因的2个SNP位点（rs1:14342082A>G,rs2:14345176A>G）可作为驴体尺性状的分子遗传标记，为驴的分子育种和品种选育提供理论支持。
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绵羊LEP、LEPR基因多态性与体况评分的相关性分析
《西南农业学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究特克赛尔×哈萨克杂交(特哈)母羊瘦素(Leptin,LEP)、瘦素受体(Leptin receptor,LEPR)基因多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)及其与体况评分(Body condition score,BCS)之间的相关性.[方法]采用PCR测序技术筛选LEP和LEPR第18外显子中的错义突变,用KASP分型方法进行SNPs分型,并将分型结果与其BCS关联分析.[结果]①在特哈母羊LEP基因上共发现1个SNPs位点,即rs1093355763,在特哈母羊LEPR基因上共发现3个SNPs位点,即rs428867159、rs412929474和 g.2770G>A,均属于外显子错义突变,rs428867159 和 rs412929474 属于中度多态(0.25
关键词： BCS LEP基因 LEPR基因 核苷酸多态性 相关性分析
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牛冠状病毒纤突蛋白的结构与功能分析
《新疆农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究新疆牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)流行株的遗传变异规律，分析纤突(Spike, S)蛋白结构与功能特征。【方法】对新疆巴楚县某牛场BCoV阳性的犊牛粪便，提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增S基因，通过序列测定和拼接，获得BCoV S基因全长序列，对其开展生物信息学分析和遗传进化分析。【结果】获得BCoV S基因核苷酸序列(GenBank索引号：OR136878.1)。S基因全长4 092核苷酸(nucleotide, nt),编码1 363氨基酸(amino acid, aa)。BCoV S蛋白分子量为150.67 Ku,等电点为5.29,有1个跨膜螺旋区，亲水性较弱，疏水性略强。S蛋白主要分布于宿主细胞的内质网膜和高尔基体，具有信号肽的概率为0.984 2,是分泌型蛋白，含有14个潜在的N-糖基化位点和132个磷酸化位点。S蛋白具有3个结构域，其中受体结合结构域(Receptor binding domain, RBD)共含有215 aa,无规则卷曲(Coiled coil, Cc)占比最高(62.79%),其次为延伸链(Extended strand, Es)(20.47%)和α-螺旋(α-helix, Hh)(12.56%),β-转角(β-turn, Tt)占比最少(4.19%)。筛选出S蛋白15个优势B细胞表位和11个T细胞表位。S蛋白能与SWISS-MODEL数据库中模板(SMTL ID:7sbw.1.C)同源建模，二者序列相似性为92.00%,模型GMQE值为0.76,QMEAN值为0.82,符合率较高，拉氏图(Ramachandran plots)的Ramachandran favored值为96.14%,表明空间构象合理，模型准确可靠。遗传进化试验扩增的BCoVS基因序列，与2016年我国新疆的BCV-Aks-01株处于同一小分支，两者S基因核苷酸序列同源性为99.1%。【结论】BCoV S蛋白存在多个抗原表位。RBD在病毒进入宿主细胞时具有重要作用，可针对RBD序列设计疫苗靶点，阻止病毒与宿主受体结合。采用生物信息学方法首次分析BCoV S蛋白理化性质、信号肽和亚细胞定位、磷酸化位点、糖基化位点、结构域、抗原表位、三级结构和RBD二级结构等特征，为BCoV S基因遗传进化、结构与功能研究、疫苗研发、靶向药物设计提供参考。
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和田羊体重与体尺指标的多元回归分析
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究旨在探索新疆和田地区和田羊体重与体尺指标的相关性。研究测定了326只（公羊60只，母羊260只）2周岁健康且无病和田羊的体重（Y）以及体高（X1）、胸围（X2）、胸深（X3）、胸宽（X4）、管围（X5）6个指标。通过相关性分析和多元线性回归建立最优回归模型。结果表明：影响和田羊公羊体重的主要体尺指标是胸围、体高、胸深，且胸围、体高与体重呈极显著正相关，胸深和体重呈显著负相关。主要影响和田羊母羊体重的体尺指标是胸围、管围、胸深，且胸围、管围与体重呈极显著正相关，胸深与体重呈极显著负相关。和田羊公羊体重的最优回归方程为Y=1.397X1+1.096X2–0.69X3–117.06（P＜0.01,R~2=0.757）；母羊体重的最优回归方程为Y=1.098X2–0.573X3+4.555X5–64.006（P＜0.01,R~2=0.678）。本分析结果适用于实际生产过程中和田羊公羊和母羊体重的估算，能够为今后的品种改良提供理论支撑。
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基于ResNet深度残差网络的白喉乌头检测
《草业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：在人类活动和气候变化的影响下，毒害草的蔓延威胁着生态安全和畜牧业的健康发展，白喉乌头（Aconitum leucostomum）是新疆伊犁地区危害最为严重的毒害草之一。为了实现天然草原异质背景下快速、精准、自动检测毒害草的目标，以白喉乌头为研究对象，利用无人机航拍正射影像构建白喉乌头数据集。基于Faster-RCNN和SSD算法，采用ResNet50和ResNet101两种深度的主干网络提取特征，对比不同方法的检测精度。结果表明：通过对比测试集的检测精度Faster-RCNN＿ResNet50的mAP （平均精确度）值最高，达到64.74%，而SSD＿ResNet50的mAP最低，仅为48.70%,Faster-RCNN＿ResNet101的mAP值为63.37%，而SSD＿ResNet101的为52.55%。本研究对从航拍正射影像中检测白喉乌头有借鉴意义和参考价值。
关键词： 毒害草 深度学习 卷积神经网络 无人机遥感 目标识别 Faster-RCNN SSD
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特克赛尔羊*阿勒泰羊F2代部分肉质性状的全基因组关联分析
《中国畜牧杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状，利用全基因组关联分析（GWAS）方法初步筛选肉质性状（熟肉率、失水率）的候选基因，并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明，以上肉质性状群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差，也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有16个SNP位点达到基因组显著水平，其中与熟肉率显著相关的位点8个，与失水率显著相关的位点8个。根据基因注释和文献检索结果，推测DOCK4、AOAH和CREB5基因可作为影响绵羊熟肉率的候选基因，所筛选出的候选基因主要通过调控肌纤维类型、参与肌肉生长过程等途径影响熟肉率；推测PRKCE和PRKG1基因可作为影响绵羊失水率的候选基因，筛选出的候选基因主要通过调控细胞分化、肌肉收缩、脂肪生成及参与肌动蛋白细胞骨架等作用而影响失水率。本研究结果将为改良绵羊肉质嫩度、多汁性提供候选分子标记，为地方品种绵羊标记辅助选择提供新的思路。
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