科研产出
选择信号分析及其对绵羊功能基因的挖掘进展
《中国畜牧兽医 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：绵羊经过长期自然和人工选择，形成了丰富多样的品种资源，并为人类提供肉、奶、毛、皮等生活物资。选择发生时伴随着选择信号的产生，常见的选择信号有群体分化、基因组多样性下降且存在高频等位基因的区域及被选择区域长范围扩展单倍型纯合等。针对不同类型的选择信号衍生出了相应的分析方法，如基于群体分化分析、基于基因组杂合度分析、基于单倍型和连锁不平衡分析和基于等位基因频率谱分析等。近年来，随着高通量测序技术的发展，研究人员通过对绵羊进行选择信号分析，挖掘出大量与经济性状相关的功能基因，为绵羊分子育种提供了更多的遗传信息。作者对选择信号的分类与检测方法及其对绵羊功能基因的筛选进行了介绍，并对选择信号分析的应用方向和研究前景进行了展望，旨在为选择信号分析在绵羊遗传育种中的应用提供借鉴。
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新疆某奶牛场奶源金黄色葡萄球菌分离鉴定、毒力基因检测和耐药性分析
《动物医学进展 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确新疆某奶牛场金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)与乳房炎的关系及流行特点,采用临诊诊断结合加州乳房炎诊断(California mastitis test,CMT),采集临床型乳房炎、CMT"+"和CMT"-"乳样,用Baird-Parker筛选、PCR法鉴定SA及其毒力基因,K-B法检测其耐药性.结果表明,采集的86份乳样有61份(71%)检出SA:临床型乳房炎、CMT"+"、CMT"-"乳样SA检出率分别为69%(24/35)、80%(33/41)和40%(4/10);hla、fnbB是临床型乳房炎和CMT"+"乳源菌株主要毒力基因,1株CMT"-"乳源菌株SA检出毒力基因;临床乳房炎和CMT"+"乳源SA对所有药物表现出不同程度的耐药性,对青霉素类抗生素耐药率在76%以上.CMT"-"乳源SA分离株对头孢他啶、庆大霉素等6种药物敏感,对其他药物耐药率在50%以下.表明该场SA导致的奶牛乳房炎严重,临床型乳房炎、CMT"+"、CMT"-"乳样均能分离出SA,不同乳源SA的分离率、毒力基因和耐药性不同.这种普遍存在的乳腺SA感染,增加了其导致临床型乳房炎的风险和牛场整体乳房炎防控难度,如何根本上清除SA的这种普遍感染,是该牛场需要面对的一个重要问题.
关键词： 奶牛乳房炎 CMT检测 金黄色葡萄球菌 毒力基因 耐药性
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石榴皮瓤提取物对成年小鼠体重增长及血浆免疫相关指标的影响
《新疆农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究石榴皮瓤提取物对小鼠体重、血浆抗氧化和促炎因子水平的影响.[方法]选择平均体重(37.31±5.57)g的成年小鼠30 只,随机分为2 组,每组15 只,分别为对照组和试验组.在相同基础日粮条件下试验组小鼠灌喂1.5g/(d·只)石榴皮瓤粗提物[即鞣花酸的灌喂量为40.74 mg/(d·只)],对照组小鼠灌喂相应体积的无菌蒸馏水,灌喂试验21 d.试验结束当天,小鼠晨饲前空腹称量体重,断尾采集小鼠血液.[结果](1)试验组小鼠的末重、总增重和平均日增重分别比对照组显著提高了8.21%(P<0.05)、47.56%(P<0.05)和48.39%(P<0.05);(2)试验组小鼠血浆中SOD、CAT、和T-AOC水平分别比对照组显著提高了24.44%(P<0.05)、54.82%(P<0.05)和27.69%(P<0.05),抑制羟自由基能力和抗超氧阴离子活力分别比对照组极显著提高了36.01%(P<0.01)和43.21%(P<0.01),显著降低了试验组小鼠血浆中MAD的浓度(P<0.05);(3)试验组小鼠血浆中TNF-α和IL-17 分别比对照组显著降低了 17.16%(P<0.05)和30.34%(P<0.05).[结论]对小鼠灌喂石榴皮瓤提取物可显著增加小鼠体重,提高小鼠抗氧化能力和抗炎症能力.
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色瓦绵羊RPL8基因的组织表达特征及生物信息学分析
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究色瓦绵羊核糖体蛋白L8基因（RPL8）在各组织部位的表达特征及其潜在功能作用，揭示RPL8基因调控色瓦绵羊产奶质量的分子作用机制，为推进色瓦绵羊的分子遗传育种提供理论依据。【方法】PCR扩增色瓦绵羊RPL8基因，通过ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0等在线软件分析RPL8基因结构特征及潜在功能，并以实时荧光定量PCR检测其在色瓦绵羊各组织中的表达分布情况。【结果】RPL8基因在色瓦绵羊乳腺、肌肉、心脏、肾脏、脾脏、肝脏、小肠、瘤胃和卵巢等9个组织中均有表达，在小肠、乳腺和卵巢中的相对表达量极显著高于其他组织中的相对表达量（P＜0.01）。色瓦绵羊RPL8基因编码区（CDS）序列长774 bp，共编码257个氨基酸残基；基于RPL8基因核苷酸序列相似性构建的系统发育进化树显示，色瓦绵羊与山羊、牦牛、牛等反刍物种的亲缘关系较近。色瓦绵羊RPL8蛋白相对分子量为28024.66Da，理论等电点（pI）为11.04，是一种稳定的碱性亲水性蛋白，不具有跨膜结构，主要定位于细胞质（占78.3%）；色瓦绵羊RPL8蛋白存在15个磷酸化位点[7个丝氨酸（S）位点，8个苏氨酸（T）位点]，其二、三级结构中均以无规则卷曲为主。色瓦绵羊RPL8蛋白的互作蛋白均为核糖体蛋白，其同源性高达99.90%，其中，RPS5、RPS16、RPL11、RPS3、RPS18和RPS11属于通用核糖体蛋白家族，RPL13属于真核核糖体蛋白家族。【结论】色瓦绵羊RPL8是一种胞内稳定的碱性亲水性蛋白，具有核糖体蛋白的基本结构特征。RPL8基因在色瓦绵羊各组织中的表达具有普遍性，尤其在乳腺和卵巢中呈高表达，说明RPL8基因除了发挥其家族基本功能作用外，在色瓦绵羊乳腺和卵巢组织中可能还影响乳脂含量与卵泡的周期性发育。
关键词： 色瓦绵羊 核糖体蛋白 RPL8基因 乳腺 卵巢 组织表达特征
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新疆维吾尔自治区动物莱姆病的流行病学调查
《中国生物制品学杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的 对新疆维吾尔自治区(简称新疆)4个地区5种蜱虫宿主动物进行莱姆病流行病学调查,并分析伯氏疏螺旋体(Borrelia burgdorferi)的流行基因型.方法 取于新疆乌鲁木齐、伊犁、昌吉及喀什4个地区采集的牛、绵羊、山羊、马和犬血清样本共814份,采用ELISA法测定血清中莱姆病IgG抗体.于上述地区收集蜱虫135只,提取DNA,以其为模板,经巢式PCR法扩增伯氏疏螺旋体5S-23SrRNA间隔区片段,取阳性样本进行测序.测序结果与GenBank中已登录的伯氏疏螺旋体5S-23SrRNA基因间隔区序列进行BLAST比对,并应用MEGA X软件构建系统进化树.结果 新疆乌鲁木齐、喀什、伊犁、昌吉地区血清样本莱姆病IgG抗体阳性率分别为23.6%、2.4%、2.7%和0,4个地区差异有统计学意义(x2=48.481,P<0.001);牛、绵羊、山羊、犬和马血清样本的莱姆病IgG抗体阳性率分别为1.1%、4.4%、18.7%、60.5%和0,5种动物差异有统计学意义(x2=129.03,P<0.001).135份蜱虫DNA样本中有24份为伯氏疏螺旋体阳性,带菌率约17.78%,包括B.garinii(占比75%)、B.afzelii(占比16.67%)、B.burgdorferi(占比8.33%)3种基因型.结论 新疆乌鲁木齐、喀什、伊犁3个地区的牛、绵羊、山羊和犬4种动物存在莱姆病感染,以B.garinii为主要流行基因型.本研究为新疆地区莱姆病的防控提供了参考.
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围栏封育和自由放牧对伊犁绢蒿生长规律和内源激素的影响
《新疆农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究围栏封育和自由放牧对伊犁绢蒿(Seriphidium transiliense)生长规律和内源激素水平的影响,分析蒿属荒漠草地围栏封育效果,为退化的蒿属荒漠草地生态系统中植被恢复研究提供理论参考依据.[方法]以围栏封育和自由放牧条件下的伊犁绢蒿为研究对象,利用植物学、植物生理学和草地管理学中有关植物形态、植物内源激素和"四度一量"方法,计数统计伊犁绢蒿高度PH、盖度PC、密度PD、生物量B、一级分枝PBN和二级分枝SBN,采取烘干法测定单株叶片干重、单株茎干重和单株根系干重,采取靶向测定内源激素(细胞分裂素IAA、脱落酸ABA、生长素CTK、赤霉素GAs、乙烯ETH)含量,每处理设置3条样线,每样线测定40个样方,对比分析各项指标,归纳总结伊犁绢蒿在两个处理下的生长规律和内源激素变化.[结果]围栏封育条件下的伊犁绢蒿株高是自由放牧株高的2.57倍,生物量是自由放牧的29.73倍,一级分枝是自由放牧的7倍,单株叶片干重、茎干重和根系干重分别是自由放牧的7.87倍、5.21倍和5.64倍;围栏封育和自由放牧对伊犁绢蒿叶片CTK和ABA含量影响较大,且差异显著(P<0.05%);对伊犁绢蒿茎内源激素含量除了赤霉素(GAs)在2个处理间差异不显著以外,其他指标在两个处理间差异均极显著(P<0.01%).围栏封育对伊犁绢蒿根系内源激素影响较小,仅ETH含量在二者之间差异显著(P<0.05%).[结论]围栏封育4年,不仅使伊犁绢蒿形态特征、生长趋势与自由放牧的小型化和矮化形成鲜明对比,尤其叶片和茎的IAA和CTK含量与植株高度和一级分枝数之间关系更密切.
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日粮粗蛋白水平和预混料对配种前期母驴体重、血液生化指标及激素水平影响的研究
《畜牧与兽医 》 2023 北大核心
摘要：旨在研究不同蛋白水平和预混料组成日粮对配种前期母驴体重、血液生化指标及雌激素相关指标的影响.选择健康、平均体重(229.18±19.11)kg、配种前3个月的经产疆岳驴母驴60头,随机均分为日粮I组和日粮II组.日粮I组饲喂低粗蛋白不含预混料的日粮,日粮Ⅱ组饲喂高蛋白+预混料的日粮,预试期10 d,正试期90d.结果:在体重方面,日粮Ⅱ组母驴第60天重、第90天重以及总增重和日增重显著高于日粮Ⅰ组(P<0.05),分别提高了4.30%、6.05%、128.53%和131.58%;在氮、糖、脂代谢方面,日粮II组母驴血浆中总蛋白、白蛋白、葡萄糖、甘油三酯、总胆固醇以及低密度脂蛋白胆固醇的含量显著高于日粮Ⅰ组(P<0.05),分别提高了35.01%、39.80%、2.36%、13.79%、25.00%和39.13%;在繁殖激素方面,日粮Ⅱ组母驴血浆中促卵泡素和促性腺激素释放激素的水平显著高于日粮Ⅰ组(P<0.05),分别提高了65.50%和37.13%.因此,饲喂本研究设计的高蛋白+预混料日粮能够显著提高配种前期母驴的体重,同时增加其血浆中蛋白浓度,促进促卵泡素和促性腺激素释放激素的分泌.
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山东省生猪屠宰环节非伤寒沙门菌污染情况及耐药特征分析
《中国食品卫生杂志 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的 了解生猪屠宰过程中非伤寒沙门菌(NTS)的污染情况和耐药特征.方法 于2021年5月和8月分别从山东省两个规模化生猪屠宰场采集共170份胴体和环境样品.对分离的NTS运用全基因组测序(WGS)技术结合生物信息学技术进行数据分析.结果 从29份样品中检出NTS,检出率为17.1%.血清型预测显示鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占58.6%(17/29).药敏结果显示29株NTS呈现15种耐药谱,四环素耐药率最高(100.0%,29/29),其次为氨苄西林和氯霉素(79.3%,23/29),多重耐药率达86.2%(25/29).多位点序列分型(MLST)结果显示ST19为主要型别,占48.3%(14/29).耐药基因分析表明主要携带tet(A)、tet(B)、tet(M)、blaTEM-1B、blaCMY-97、floR、cmlA1等.结论 山东省部分生猪屠宰场屠宰环节存在NTS污染现象,且NTS对多类抗生素表现出多重耐药性,提示应重视生猪屠宰环节中NTS的污染与防控.
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牛G3BP1蛋白的原核表达及其对牛cGAS生物酶催化活性的影响
《中国兽医科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了探究牛G3BP1(bG3BP1)对DNA识别受体cGAS生物酶催化活性的影响,本研究提取牛血液淋巴细胞中总的RNA,经RT-PCR反转录成cDNA,克隆出bG3BP1基因全长;随后构建bG3BP1的原核表达载体pET-28a-SUMO-bG3BP1,将其转化至大肠杆菌中进行诱导表达,使用镍亲和层析柱对重组蛋白bG3BP1进行纯化,并切除His6-SUMO标签后再经镍柱纯化;最后将获得的bG3BP1蛋白用于牛cGAS(bcGAS)的体外酶促反应,采用ELISA方法检测酶促合成产率.结果显示,可溶性表达的bG3BP1蛋白促进了 bcGAS的体外酶促反应,提高了第二信使分子2'3'-cGAMP的产率,这为2'3'-cGAMP的大规模生产及应用提供了研究思路和技术方法.
关键词： 牛cGAS 牛G3BP1 原核表达 第二信使分子 酶促反应
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绵羊Myf5基因多态性与胴体性状的相关性分析
《黑龙江畜牧兽医 》 2022 北大核心
摘要：为研究特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊Myf5基因多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)及其与胴体性状之间的关系,试验采用PCR测序技术和飞行时间质谱检测分型方法对434只特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊的Myf5基因SNPs进行分型,并将分型结果与其胴体性状(胴体重、胴体长、踝骨宽、臀宽、胸宽、肩宽和胸深)进行关联分析。结果表明:在Myf5基因上共发现了5个SNPs位点,即A116460176G、rs604841316、rs416158998、rs588855095和rs412277497。其中rs416158998属于内含子突变,在特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊中表现为中度多态[0.25<多态信息含量(PIC)<0.5],不处于Hard-Weinberg平衡状态(P≤0.05),与胸宽、肩宽和臀宽呈显著或者极显著相关(P<0.05或P<0.01)。rs588855095属于内含子突变,在绵羊中表现为低度多态(PIC≤0.25),处于Hard-Weinberg平衡状态(P>0.05),与臀宽呈显著相关(P<0.05)。rs412277497属于外显子上丝氨酸到半胱氨酸的错义突变,在绵羊中表现为中度多态(0.25
关键词： 特克赛尔×哈萨克横交F2代绵羊 Myf5基因 核苷酸多态性 胴体性状 相关性分析
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