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吐鲁番黑羊体重和体尺性状全基因组关联分析

畜牧兽医学报 2025 北大核心 CSCD

摘要:旨在利用全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)挖掘与鉴定吐鲁番黑羊体重和体尺性状的相关候选基因及分子标记,为吐鲁番黑羊的选育提高及资源开发利用提供科学依据.本研究选取129只年龄在1~3岁、饲养环境一致的健康吐鲁番黑羊公羊,测定体重、体高、体斜长、胸围、管围、胸宽、胸深、尾宽、尾长共9项体重体尺性状表型数据;随后使用的一次性采血管(添加EDTA-K2抗凝剂)采集5 mL颈静脉外周血提取DNA.对合格的DNA样本进行简化基因组测序(genotyping-by-sequencing,GBS),运用samtools、bcftools等软件对原始测序数据进行检测、过滤及功能注释;然后利用GCTA、TreeBeST、GEMMA等软件分别完成群体遗传结构分析、群体分层评估及全基因组关联分析.本研究测序得到160.88 G的Raw data,质控后Clean data为157.87 G,获得460 766个SNPs位点.全基因关联分析在9个性状中共筛选到74个显著SNPs位点(P<10-5),进一步注释得到到39个候选基因.单倍型分析发现候选基因的多个显著位点均位于单倍型block区域内.本研究鉴定了与吐鲁番黑羊体重体尺性状显著关联的SNP位点及候选基因,为深入解析这些性状的遗传机制提供了重要依据,同时也为吐鲁番黑羊分子标记辅助育种提供了基础数据.

关键词: 吐鲁番黑羊 体尺性状 全基因组关联分析 单倍型分析

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采用SNP芯片分析博格达绒山羊群体遗传结构和遗传多样性

黑龙江畜牧兽医 2025 北大核心

摘要:为了解博格达绒山羊群体结构和遗传多样性,试验采用山羊Illumina 65K SNP芯片对96只博格达绒山羊群体遗传多样性、近交程度、遗传距离和家系结构进行分析.结果表明:博格达绒山羊单核苷酸多态性(SNP)数量质量控制后为51 480个,有效群体含量(Ne)为11.8,多态性标记比例(PN)为0.902,群体平均期望杂合度为(He)0.379,观察杂合度(Ho)为0.364,平均多态信息含量(PIC)为0.284;共检测到1 545个连续性纯合片段(ROH)片段,平均长度为127.83 Mb,91只绒山羊的ROH片段长度在0~500 Mb之间;通过ROH计算的群体平均近交系数为0.052,状态同源(IBS)平均遗传距离为0.307 7;群体可以划分为14个家系.说明博格达绒山羊群体处于中度多态水平,遗传多样性较高,存在一定程度的近交,家系数量较多,但大部分家系公羊数量少,需要制订科学的选配计划,引入新的公羊品种或血统,以增加种群的遗传多样性.

关键词: 博格达绒山羊 SNP芯片 ROH 遗传多样性 遗传结构

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不同饲养方式对新疆肉用褐牛屠宰性能、肉品质和血液生化指标的影响

中国畜牧杂志 2025 北大核心 CSCD

摘要:本试验旨在研究栓系和散栏 2 种饲养方式下新疆肉用褐牛的屠宰性能、肉品质的差异及其与血液生化指标的相关性.选取15月龄、平均体重300 kg且健康状态良好的新疆肉用褐牛20头,分成2组,每组10头,饲养方式分别为栓系和散栏,饲养至 30 月龄进行尾部静脉采血、屠宰.结果显示:①散栏新疆肉用褐牛的屠宰率、净肉率和肉骨比极显著高于栓系,净肉重显著高于栓系新疆肉用褐牛.②与散栏新疆肉用褐牛辣椒条相比,栓系新疆肉用褐牛蒸煮损失率、肉色亮度(L*)、红度(a*)、黄度(b*)值极显著降低,系水力、pH极显著升高,剪切力差异不显著.③与散栏新疆肉用褐牛相比,栓系新疆肉用褐牛的白蛋白、白球比、总胆红素、肌酸激酶、肌酐和尿素含量极显著升高,球蛋白、丙氨酸氨基转移酶、淀粉酶、脂肪酶和无机磷含量极显著降低,TP含量显著降低.④栓系和散栏新疆肉用褐牛只有部分血液生化性状和屠宰性状存在相关性,栓系新疆肉用褐牛血清中总胆红素与肉骨比呈极显著负相关,与净肉率呈显著正相关;肌酸激酶与屠宰率呈显著正相关.本试验条件下,散栏饲养可以提高新疆肉用褐牛的屠宰性能,在肝脏功能状态、营养代谢水平和免疫机能等方面也优于栓系饲养新疆肉用褐牛.而部分血液生化指标与屠宰性能、肉质性状存在相关性,相关程度有强有弱,这种相关关系可以作为屠宰性能和肉质性状指标的预测,为提前选种选育及性能测定提供参考.

关键词: 栓系和散栏 新疆肉用褐牛 屠宰性能 肉品质 血液生化指标

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特哈肉羊繁殖性状的遗传分析

中国畜牧杂志 2025 北大核心

摘要:本研究共收集3 577只特哈母羊的7 359条繁殖性能记录作为试验数据,包括胎产羔数、平均出生窝重、平均断奶窝重、妊娠期、断奶羔羊数、出生窝重和断奶窝重.运用ASReml-R软件的GLM过程和动物模型进行显著性检验并估计遗传参数及育种值,旨在为特哈肉羊(暂定名,以下简称"特哈肉羊")后期育种规划和科学选育提供理论依据.结果表明:出生年份、月份及出生类型对所有性状均有显著影响;胎次对胎产羔数、出生窝重及平均出生窝重有显著影响,代次及母羊年龄对断奶羔羊数无显著影响.胎产羔数、断奶羔羊数、妊娠期、平均出生窝重、平均断奶窝重、出生窝重和断奶窝重的遗传力估计值为0.084、0.029、0.122、0.227、0.141、0.203、0.087.繁殖性状之间的遗传相关性估计范围为-0.112~0.998,表型相关性范围为-0.204~0.967.随着年份的增加,出生窝重、断奶窝重及平均断奶窝重等繁殖性状的平均育种值整体呈上升趋势,其余性状整体呈下降趋势;断奶窝重、断奶羔羊数及平均断奶窝重平均表型值整体呈下降趋势,其余性状整体呈上升趋势,但总的波动不大.可见,由于特哈肉羊的繁殖性状遗传力较低,近 4 年来整体遗传进展缓慢.因此,在特哈肉羊未来的育种规划内,应加强对高繁母羊的选育,以提高整个群体的繁殖性能.

关键词: 繁殖性状 遗传参数 相关性 遗传趋势

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皮山红羊与湖羊1~180日龄生长发育性状的比较研究

中国畜牧杂志 2025 北大核心

摘要:本研究旨在对比探究皮山红羊与湖羊早期生长发育规律,为肉羊选育选配奠定基础.试验选取 225只皮山红羊母羊和 238 只湖羊母羊所产的 919 只羊羔,分别对羔羊 1、15、30、45、60、180 日龄体重、体高、体长、胸围和管围进行测量,并对各个指标的相对生长、绝对生长和累积生长进行单因素方差分析,利用Logistic、Gompertz和Von Bertalanffy模型对体重进行生长曲线拟合.结果发现,皮山红羊和湖羊公母羊1~30 日龄体重、体尺指标及体重和各体尺指标的累积生长无显著差异;45~180 日龄皮山红羊公母羊体重、体长和胸围以及体重、体高、体长和胸围的累积生长显著大于湖羊.整个阶段皮山红羊与湖羊公母羊体重与体尺指标的累积生长、绝对生长和相对生长呈现不同程度的差异性.在 3 种模型中,Von Bertalanffy模型对皮山红羊和湖羊体重的拟合度均高达 0.998 以上,并且其拟合值与实测值之间的吻合程度最高.因此,可以将Von Bertalanffy模型视为描述皮山红羊与湖羊早期生长性状的最佳拟合模型.

关键词: 皮山红羊 湖羊 体重 体尺 早期生长发育 非线性回归模型

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牛冠状病毒S蛋白生物信息学分析及其受体结合域的多克隆抗体制备

畜牧与兽医 2025 北大核心

摘要:旨在预测和分析牛冠状病毒(BCoV)S蛋白的结构和潜在功能,并进行克隆表达及多克隆抗体的制备,为疫苗研究和实验室诊断提供基础.利用生物信息学软件预测分析S蛋白生物学特性,克隆其受体结合域(RBD)基因并与原核表达载体pET-30a(+)连接,构建重组质粒后转化BL21感受态细胞并利用IPTG诱导表达,表达的蛋白经镍柱纯化后免疫小鼠,制备多克隆抗体并检测.结果:S蛋白由1 364个氨基酸组成,相对分子质量为150.81 kDa,等电点为5.51,不稳定指数为33.22,脂溶性指数为87.22;该蛋白1~1 307 aa为胞外区,1 308~1330aa为跨膜区,1331~1 363 aa为胞内区,1~14 aa为信号肽,310-612 aa为RBD;有36个潜在的B细胞表位,RBD中包含12个;该蛋白α-螺旋占27.95%,β-折叠占23.04%,无规则卷曲占49.01%;分析S蛋白三级结构,与二级结构预测结果基本一致;成功克隆了 S蛋白RBD,大小与预期相符,与载体pET-30a(+)连接后经双酶切、测序验证表明载体构建成功;经SDS-PAGE与Western blot验证蛋白成功表达后,将纯化后的蛋白免疫小鼠并分离血清,效价可达1∶128 000;经间接免疫荧光试验与Western blot验证多克隆抗体能够识别病毒S蛋白,证明重组蛋白具有良好的免疫原性,可诱导产生病毒特异性抗体.结论:成功分析和预测了 BCoV S蛋白的结构及功能,并获得S蛋白RBD的重组蛋白及多克隆抗体,为后续的研究奠定了基础.

关键词: 牛冠状病毒 S蛋白 受体结合域 生物特性 多克隆抗体

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哈萨克羊胎儿期臀脂前体脂肪细胞的增殖和分化特性研究

中国畜牧兽医 2025 北大核心

摘要:[目的]分离哈萨克羊臀脂形成关键窗口期的前体脂肪细胞,从组织学和细胞学角度掌握哈萨克羊臀脂沉积的发育性特征,为深入研究绵羊臀脂沉积的分子机制奠定基础.[方法]采集哈萨克羊妊娠第50(E50)、60(E60)、70(E70)、80(E80)、94(E94)和105(E105)天的胎儿,观察其臀脂形态变化,并对E70、E80及E94时期胎儿的臀脂组织进行油红O染色及成脂分化相关基因的表达检测,确定哈萨克羊臀脂沉积的关键时期.利用Ⅰ型胶原酶分段消化法分离E70、E80和E94时期哈萨克羊臀脂前体脂肪细胞,连续培养6 d以绘制细胞生长曲线,比较3个胎儿期来源的前体脂肪细胞增殖能力.对E70、E80和E94时期哈萨克羊臀脂前体脂肪细胞进行成脂诱导分化,通过油红O染色、脂滴含量测定及成脂分化相关基因表达水平的实时荧光定量PCR检测,比较不同胎儿期获得的前体脂肪细胞的成脂分化特性.[结果]哈萨克羊E70时期出现明显的脂臀形态,E80时期臀部组织开始出现明显的脂滴,并在E94时期脂滴积累增多.成脂分化相关基因表达量随妊娠时间逐渐增加,且在E80~E94时期呈倍数增加.通过Ⅰ型胶原酶分段消化法分离获得E70、E80和E94时期的哈萨克羊臀脂前体脂肪细胞,细胞形态均呈成纤维细胞样,生长活力良好;3个时期的前体脂肪细胞经诱导分化处理后均有成熟脂滴生成,且成脂分化相关基因CEBPα、PPARγ、LPL和FABP4表达量较诱导分化前均显著增加(P<0.05).E80时期前体脂肪细胞在诱导分化第3天即形成脂滴,相较于E70和E94时期脂滴形成时间最短、含量最高.[结论]本研究分离获得的哈萨克羊E70、E80和E94时期胎儿臀脂前体脂肪细胞增殖活力良好,可诱导分化形成成熟脂滴,且E80时期臀脂前体脂肪细胞分化能力更强.

关键词: 哈萨克羊 胎儿期 臀脂 前体脂肪细胞 原代分离培养 成脂分化相关基因

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基于简化基因组测序的吐鲁番黑羊遗传结构分析

中国畜牧兽医 2025 北大核心

摘要:【目的】研究吐鲁番黑羊育种核心群种公羊的群体遗传结构及亲缘关系,探讨吐鲁番黑羊的遗传多样性,评估其群体遗传结构,为制定合理的选种选配方案及吐鲁番黑羊品种保护策略提供数据支持。【方法】利用简化基因组测序技术对128只吐鲁番黑羊公羊单核苷酸多态性(SNP)位点进行检测,通过PLINK 1.90、R 4.4.1软件对吐鲁番黑羊群体遗传多样性及连续纯合片段(ROH)进行计算,利用Mega 10.0软件构建系统进化树,综合评估吐鲁番黑羊的群体遗传结构。【结果】吐鲁番黑羊公羊群体平均观测杂合度为0.16,期望杂合度为0.18,次要等位基因频率为0.23,多态信息含量为0.82。通过主成分分析与系统进化树发现,128只吐鲁番黑羊被分为5个亚群。遗传距离(D值)为0.1626~0.2749,平均遗传距离为0.2635,IBS遗传距离与亲缘关系G矩阵一致,显示吐鲁番黑羊群体内大部分个体间亲缘关系较远。128个吐鲁番黑羊公羊个体共检测到2 239个ROHs,其中,0~5 Mb数量最多,占比为61.37%;基于ROH的平均近交系数为0.04,表明近亲繁殖水平较低。【结论】吐鲁番黑羊育种核心群遗传多样性丰富,大部分个体间亲缘关系较远,群体内近交程度较低,具有较好的遗传资源保护和开发利用的基础。本研究结果可为吐鲁番黑羊核心群制定育种计划及开发利用提供参考依据。

关键词: 吐鲁番黑羊 群体遗传结构 亲缘关系 连续纯合片段

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日粮添加残次红枣对奶牛泌乳性能及血液生化指标的影响

中国饲料 2025 北大核心

摘要:为探究泌乳牛饲粮中添加不同比例的残次红枣,对其采食量、产乳量、乳成分、血清生化及免疫指标的影响,本试验选取、年龄、胎次和泌乳天数[(200±5)d]相近的泌乳后期荷斯坦奶牛32头,随机分为4组,每组8头,分别为对照组和添加残次枣粉5%组、10%组和15%组。试验期37 d,其中预饲期7 d,正试期30 d,试验期间采集饲料样、奶样、血液等样本用于测定分析。结果表明:(1)与对照组相比,5%组和15%组干物质采食量极显著降低(P<0.01);(2)与对照组相比,15%组牛乳中乳铁蛋白含量、SOD活力显著升高(P<0.05),DPPH自由基清除率极显著升高(P<0.01);10%组牛乳中乳脂率、DPPH自由基清除率极显著升高(P<0.01);(3)与对照组相比,15%组血清中GLU含量、IGF-I含量、DPPH自由基清除率极显著升高(P<0.01),INS含量显著升高(P<0.05),GH含量极显著降低(P<0.01);10%组IGF-I含量显著降低(P<0.05),MDA含量极显著降低(P<0.01),DPPH自由基清除率极显著增加(P<0.01);5%组IGF-I含量显著降低,DPPH自由基清除率极显著增加(P<0.01)。综上所述,泌乳牛饲喂残次红枣可极显著降低采食量,提高牛乳中乳铁蛋白含量、SOD活力、乳脂率、DPPH自由基清除率,血清中GLU含量、IGF-I含量、DPPH自由基清除率。在本试验条件下,结合泌乳牛采食量、产乳量、乳成分、血清生化及免疫指标,推荐日粮中添加15%残次红枣。

关键词: 红枣 奶牛 泌乳性能 生化指标

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绵羊miR-432对MFSD12基因表达的调控

中国畜牧杂志 2025 北大核心 CSCD

摘要:试验旨在探讨miR-432 与MFSD12基因的靶向关系.利用miRanda、targetscan在线预测miR-432 的靶基因,并对靶基因 3'-UTR区可能与miR-432 结合的位点进行分析.利用Xho I、Not I将绵羊MFSD12基因的野生型及突变型序列插入psiCHECK-2 载体,构建psiCHECK-2-MFSD12-W-3'-UTR和psiCHECK-2-MFSD12-W-3'-UTR载体并与miR-432 mimics及其阴性对照共转染 293T细胞,利用双荧光素酶试剂盒测定荧光素酶活性.同时利用荧光定量PCR和Western Blot检测过表达/抑制miR-432 后MFSD12在mRNA和蛋白表达水平的变化.结果显示,与阴性对照组相比,psiCHECK-2-MFSD12-W-3'-UTR+miR-432 mimics荧光素酶活性极显著降低.转染miR-432 mimics显著下调MFSD12基因mRNA和蛋白的表达,而转染miR-432 inhibitor组与阴性对照组相比,MFSD12基因mRNA和蛋白的表达差异不显著.本研究成功构建了MFSD12野生型及突变型载体,证实绵羊miR-432 可靶向调控MFSD12基因的表达.

关键词: miR-432 MFSD12基因 表达调控

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